85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2726 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2726  surface antigen (D15)  100 
 
 		 806 aa  1642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0992  surface antigen (D15)  40.34 
 
 		 875 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1917  outer membrane protein  30.02 
 
 		 809 aa  363  7.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.220726 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1648  hypothetical protein  27.18 
 
 		 780 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  27.04 
 
 		 772 aa  220  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1223  outer membrane protein  26.69 
 
 		 766 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.760862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  26.98 
 
 		 810 aa  214  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  24.45 
 
 		 851 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12263  hypothetical protein  24.74 
 
 		 853 aa  208  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.167756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1269  surface antigen (D15)  27.5 
 
 		 769 aa  208  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.743361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0735  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 767 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000801153  hitchhiker  0.00000000000164396 
 
 
-
 
NC_002950  PG0980  hypothetical protein  26.27 
 
 		 745 aa  201  6e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3472  surface antigen (D15)  27.48 
 
 		 774 aa  194  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.151472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  24.38 
 
 		 858 aa  194  7e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  26.38 
 
 		 762 aa  193  9e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  25.85 
 
 		 775 aa  165  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  24.83 
 
 		 808 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3196  surface antigen (D15)  23.96 
 
 		 811 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2555  surface antigen (D15)  24.3 
 
 		 803 aa  134  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0470  surface antigen (D15)  23.82 
 
 		 730 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0492  surface antigen (D15)  23.09 
 
 		 761 aa  121  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0537  surface antigen (D15)  25.63 
 
 		 722 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0533  surface antigen (D15)  22.93 
 
 		 743 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.885553  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0176  hypothetical protein  22.63 
 
 		 741 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1648  hypothetical protein  23.36 
 
 		 725 aa  84.3  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  21.32 
 
 		 610 aa  80.5  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0652  surface antigen (D15)  22.41 
 
 		 734 aa  74.7  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.496085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  20.53 
 
 		 673 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  32.72 
 
 		 657 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  30.43 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  30.43 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  30.27 
 
 		 786 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  30.93 
 
 		 786 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  30.93 
 
 		 786 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  30.06 
 
 		 577 aa  52  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  30.06 
 
 		 577 aa  52  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  30.06 
 
 		 577 aa  52  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.65 
 
 		 784 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  30.06 
 
 		 577 aa  52  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  30.06 
 
 		 577 aa  52  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  30.06 
 
 		 577 aa  52  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  29.9 
 
 		 796 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  30.06 
 
 		 577 aa  52  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  30.06 
 
 		 577 aa  52  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.16 
 
 		 787 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  30.06 
 
 		 577 aa  52  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.66 
 
 		 791 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  33.56 
 
 		 577 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  33.56 
 
 		 577 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  33.56 
 
 		 577 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  28.65 
 
 		 795 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  33.56 
 
 		 577 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  33.56 
 
 		 577 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  28.65 
 
 		 636 aa  49.3  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  29.19 
 
 		 622 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  27.43 
 
 		 584 aa  48.9  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.57 
 
 		 772 aa  48.9  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.51 
 
 		 790 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.64 
 
 		 751 aa  48.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  29.68 
 
 		 827 aa  48.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  29.71 
 
 		 622 aa  48.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  29.82 
 
 		 794 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  27.03 
 
 		 598 aa  47.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0671  surface antigen (D15)  26.09 
 
 		 612 aa  47.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  30.99 
 
 		 596 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  28.04 
 
 		 787 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  26.98 
 
 		 787 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.51 
 
 		 799 aa  47  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  21.99 
 
 		 702 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  30.25 
 
 		 643 aa  45.8  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  29.79 
 
 		 792 aa  46.2  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1257  surface antigen (D15)  31.21 
 
 		 824 aa  45.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00322017  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  26.99 
 
 		 1126 aa  45.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  26.29 
 
 		 781 aa  45.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  25.15 
 
 		 799 aa  45.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  28.67 
 
 		 573 aa  45.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  29.48 
 
 		 577 aa  44.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  29.68 
 
 		 827 aa  45.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  29.03 
 
 		 826 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  29.03 
 
 		 826 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.24 
 
 		 797 aa  44.3  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.41 
 
 		 826 aa  44.3  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  29.41 
 
 		 826 aa  44.3  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1045 aa  44.3  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  29.41 
 
 		 826 aa  44.3  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>