92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2095 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  100 
 
 
775 aa  1592    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  30.42 
 
 
762 aa  318  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  29.57 
 
 
772 aa  313  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1223  outer membrane protein  27.52 
 
 
766 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.760862  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0735  surface antigen (D15)  28.13 
 
 
767 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000801153  hitchhiker  0.00000000000164396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3472  surface antigen (D15)  27.94 
 
 
774 aa  279  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.151472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  25.7 
 
 
810 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  27.59 
 
 
808 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0980  hypothetical protein  27.51 
 
 
745 aa  218  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1917  outer membrane protein  26.82 
 
 
809 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.220726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3196  surface antigen (D15)  26.9 
 
 
811 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0992  surface antigen (D15)  24.79 
 
 
875 aa  188  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4186  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1269  surface antigen (D15)  26.14 
 
 
769 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.743361  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2726  surface antigen (D15)  26.13 
 
 
806 aa  168  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1648  hypothetical protein  25.93 
 
 
780 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  22.64 
 
 
851 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0537  surface antigen (D15)  22.43 
 
 
722 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0533  surface antigen (D15)  22.74 
 
 
743 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.885553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0470  surface antigen (D15)  24.01 
 
 
730 aa  107  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0492  surface antigen (D15)  22.89 
 
 
761 aa  105  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12263  hypothetical protein  30.04 
 
 
853 aa  105  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.167756  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  27.44 
 
 
858 aa  104  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2555  surface antigen (D15)  23.68 
 
 
803 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0176  hypothetical protein  23.44 
 
 
741 aa  96.3  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0652  surface antigen (D15)  22.71 
 
 
734 aa  94  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.496085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1648  hypothetical protein  22.32 
 
 
725 aa  85.5  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  32.22 
 
 
665 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  29.76 
 
 
629 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  29.81 
 
 
661 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  29.17 
 
 
612 aa  55.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  22.56 
 
 
758 aa  54.7  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  32.39 
 
 
961 aa  54.7  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  33.33 
 
 
751 aa  54.7  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  29.17 
 
 
613 aa  52.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  31.5 
 
 
633 aa  52.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  31.46 
 
 
835 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  26.34 
 
 
673 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  29.07 
 
 
652 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  33.06 
 
 
702 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  28.57 
 
 
661 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  28.57 
 
 
661 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.73 
 
 
772 aa  50.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  20.8 
 
 
647 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  26.57 
 
 
622 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  18.72 
 
 
610 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  28.64 
 
 
674 aa  49.3  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  23.28 
 
 
769 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  28.24 
 
 
609 aa  48.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0248  surface antigen (D15)  27.03 
 
 
926 aa  48.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  27.54 
 
 
584 aa  47.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  30.92 
 
 
843 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  28.82 
 
 
663 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  22.51 
 
 
781 aa  47.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  32.17 
 
 
670 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.34 
 
 
768 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  20.54 
 
 
844 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  26.19 
 
 
598 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  23.87 
 
 
677 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  24.83 
 
 
573 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  25.87 
 
 
622 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  25.13 
 
 
820 aa  45.8  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.23 
 
 
895 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  28.66 
 
 
593 aa  46.2  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  30.34 
 
 
769 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  30.34 
 
 
768 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  30.34 
 
 
769 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  23.78 
 
 
582 aa  45.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.34 
 
 
769 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  26.95 
 
 
677 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  31.88 
 
 
595 aa  45.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  26.95 
 
 
677 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  27.54 
 
 
657 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  23.76 
 
 
634 aa  45.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.78 
 
 
769 aa  45.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  25.14 
 
 
1126 aa  45.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.52 
 
 
781 aa  45.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.47 
 
 
784 aa  45.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  23.76 
 
 
634 aa  45.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  25.14 
 
 
1045 aa  44.7  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  30.7 
 
 
752 aa  44.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  29.78 
 
 
768 aa  44.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  21.39 
 
 
827 aa  44.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.09 
 
 
793 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  27.82 
 
 
573 aa  44.3  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  29.21 
 
 
768 aa  44.3  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  29.21 
 
 
769 aa  44.3  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  29.21 
 
 
768 aa  44.3  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  29.21 
 
 
768 aa  44.3  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  29.21 
 
 
769 aa  44.3  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  29.21 
 
 
769 aa  44.3  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  29.21 
 
 
768 aa  44.3  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.33 
 
 
769 aa  43.9  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>