169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0735 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0735  surface antigen (D15)  100 
 
 		 767 aa  1573    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000801153  hitchhiker  0.00000000000164396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  41.69 
 
 		 772 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3472  surface antigen (D15)  42.43 
 
 		 774 aa  598  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.151472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  35.52 
 
 		 808 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1223  outer membrane protein  33.81 
 
 		 766 aa  462  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.760862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3196  surface antigen (D15)  36.2 
 
 		 811 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  33.12 
 
 		 762 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  27.65 
 
 		 810 aa  343  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 775 aa  277  5e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1269  surface antigen (D15)  28.55 
 
 		 769 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.743361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1917  outer membrane protein  28.1 
 
 		 809 aa  258  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.220726 
 
 
-
 
NC_002950  PG0980  hypothetical protein  27.2 
 
 		 745 aa  214  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1648  hypothetical protein  26.54 
 
 		 780 aa  211  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2726  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 806 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  23.94 
 
 		 851 aa  198  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0992  surface antigen (D15)  24.34 
 
 		 875 aa  197  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12263  hypothetical protein  22.27 
 
 		 853 aa  189  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.167756  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0492  surface antigen (D15)  24.39 
 
 		 761 aa  137  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0470  surface antigen (D15)  24 
 
 		 730 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0533  surface antigen (D15)  23.07 
 
 		 743 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.885553  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  32.18 
 
 		 858 aa  120  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2555  surface antigen (D15)  24.46 
 
 		 803 aa  119  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0652  surface antigen (D15)  22.66 
 
 		 734 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.496085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1648  hypothetical protein  22.68 
 
 		 725 aa  103  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0537  surface antigen (D15)  22.66 
 
 		 722 aa  102  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0176  hypothetical protein  23.01 
 
 		 741 aa  99.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  31.94 
 
 		 781 aa  70.5  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  31.65 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.67 
 
 		 787 aa  60.1  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.98 
 
 		 768 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  31.98 
 
 		 769 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  31.98 
 
 		 768 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  34.82 
 
 		 761 aa  58.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.98 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  31.98 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  31.98 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  27.7 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  31.78 
 
 		 760 aa  57.4  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  29.73 
 
 		 787 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3695  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 1128 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0630006  normal  0.0367539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  30.23 
 
 		 768 aa  57  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2968  surface antigen (D15)  27.13 
 
 		 802 aa  57  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  30.23 
 
 		 769 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  30.23 
 
 		 769 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  33.52 
 
 		 633 aa  56.6  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  30.23 
 
 		 768 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  30.23 
 
 		 768 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  30.23 
 
 		 769 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  30.23 
 
 		 768 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  30.23 
 
 		 768 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  29.73 
 
 		 787 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  36 
 
 		 815 aa  55.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  28.21 
 
 		 657 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.81 
 
 		 769 aa  55.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  27.56 
 
 		 677 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  28.4 
 
 		 770 aa  55.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  27.56 
 
 		 677 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  25.97 
 
 		 788 aa  54.7  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.05 
 
 		 799 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  31.71 
 
 		 765 aa  54.3  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25 
 
 		 769 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  26.4 
 
 		 784 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.4 
 
 		 784 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.45 
 
 		 770 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.74 
 
 		 769 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  29.91 
 
 		 799 aa  53.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0689  surface antigen (D15)  23.83 
 
 		 1029 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508151  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  40.28 
 
 		 844 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  31.33 
 
 		 765 aa  53.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  39.74 
 
 		 804 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  38.89 
 
 		 827 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.33 
 
 		 765 aa  53.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.45 
 
 		 809 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.64 
 
 		 770 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  36.14 
 
 		 826 aa  52  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  33.62 
 
 		 790 aa  52  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  23.26 
 
 		 782 aa  51.6  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03229  outer membrane protein assembly factor YaeT  31.3 
 
 		 804 aa  51.6  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.29 
 
 		 784 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  29.29 
 
 		 702 aa  51.2  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  40.28 
 
 		 827 aa  50.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.7 
 
 		 784 aa  51.2  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  28.4 
 
 		 677 aa  50.8  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  26.67 
 
 		 613 aa  50.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  27.78 
 
 		 765 aa  50.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  25.85 
 
 		 786 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  25.35 
 
 		 827 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  32.45 
 
 		 661 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  32.45 
 
 		 661 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.06 
 
 		 758 aa  50.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  37.5 
 
 		 826 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  38.89 
 
 		 827 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  27.94 
 
 		 758 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  38.16 
 
 		 803 aa  50.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  38.89 
 
 		 826 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.5 
 
 		 827 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  38.89 
 
 		 826 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  37.5 
 
 		 826 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  27.6 
 
 		 830 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.89 
 
 		 826 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>