More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0533 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0470  surface antigen (D15)  64.94 
 
 		 730 aa  996    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0492  surface antigen (D15)  48.43 
 
 		 761 aa  753    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0537  surface antigen (D15)  50.68 
 
 		 722 aa  749    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1648  hypothetical protein  58.54 
 
 		 725 aa  900    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0176  hypothetical protein  55.83 
 
 		 741 aa  868    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0652  surface antigen (D15)  62.69 
 
 		 734 aa  947    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.496085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0533  surface antigen (D15)  100 
 
 		 743 aa  1518    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.885553  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2555  surface antigen (D15)  25.91 
 
 		 803 aa  204  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1223  outer membrane protein  23.58 
 
 		 766 aa  127  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.760862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1648  hypothetical protein  22.85 
 
 		 780 aa  122  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0735  surface antigen (D15)  23.07 
 
 		 767 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000801153  hitchhiker  0.00000000000164396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1269  surface antigen (D15)  24.71 
 
 		 769 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.743361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3472  surface antigen (D15)  23.62 
 
 		 774 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.151472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  24.48 
 
 		 858 aa  113  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0992  surface antigen (D15)  22.63 
 
 		 875 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  22.61 
 
 		 775 aa  106  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1917  outer membrane protein  22.84 
 
 		 809 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.220726 
 
 
-
 
NC_002950  PG0980  hypothetical protein  26 
 
 		 745 aa  103  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  22.45 
 
 		 772 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12263  hypothetical protein  23.02 
 
 		 853 aa  102  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.167756  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  22.35 
 
 		 762 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  36.61 
 
 		 810 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  22.22 
 
 		 808 aa  92  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2726  surface antigen (D15)  22.93 
 
 		 806 aa  87.4  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3196  surface antigen (D15)  23.08 
 
 		 811 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 851 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  32.12 
 
 		 622 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  33.13 
 
 		 610 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.72 
 
 		 784 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  33.53 
 
 		 835 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  34.38 
 
 		 595 aa  69.3  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  21.02 
 
 		 795 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  21.23 
 
 		 791 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  32.85 
 
 		 622 aa  68.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  28.81 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  23.55 
 
 		 786 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  23.82 
 
 		 674 aa  67.4  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  33.95 
 
 		 752 aa  67.4  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  34.59 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  34.59 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  30.77 
 
 		 633 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  22.6 
 
 		 794 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  29.83 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  33.83 
 
 		 657 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  29.83 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  31.36 
 
 		 702 aa  64.7  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001694  uncharacterized protein YtfM precursor  30.85 
 
 		 570 aa  65.1  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  34.01 
 
 		 580 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  32.39 
 
 		 776 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  29.03 
 
 		 573 aa  63.9  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  33.56 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.36 
 
 		 797 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  33.56 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  33.56 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  33.56 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  33.56 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  30.99 
 
 		 820 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  22.3 
 
 		 796 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  30.85 
 
 		 570 aa  62.4  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  34.01 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  32.43 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  32.43 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  32.43 
 
 		 577 aa  62  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  32.43 
 
 		 577 aa  62  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  32.43 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  31.25 
 
 		 643 aa  62  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  32.43 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  32.43 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  27.11 
 
 		 608 aa  61.6  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  32.43 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  32.43 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.1 
 
 		 793 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.1 
 
 		 793 aa  61.6  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  28.31 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  30.86 
 
 		 806 aa  61.6  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.77 
 
 		 772 aa  61.2  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  28.4 
 
 		 609 aa  60.8  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 637 aa  60.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.61 
 
 		 895 aa  60.8  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  23.82 
 
 		 653 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 583 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.11 
 
 		 787 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 583 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  31.25 
 
 		 779 aa  60.1  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  31.4 
 
 		 999 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  22.27 
 
 		 647 aa  60.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  33.57 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  27.39 
 
 		 1002 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  21.17 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  32.65 
 
 		 574 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  35.59 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  35.59 
 
 		 629 aa  58.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  32.86 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  30.2 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  28.48 
 
 		 751 aa  58.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  30.77 
 
 		 579 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  30.77 
 
 		 579 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  31.08 
 
 		 843 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  20.91 
 
 		 786 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  33.78 
 
 		 577 aa  57.4  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>