More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8325 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 317 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  53.15 
 
 		 335 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  57.43 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  56.23 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  56.23 
 
 		 306 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  57.62 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  54.28 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  53.97 
 
 		 305 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  54.3 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  52.65 
 
 		 314 aa  262  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  54.64 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  49.55 
 
 		 354 aa  255  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  56.51 
 
 		 358 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  51.61 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  54.49 
 
 		 313 aa  248  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  51.32 
 
 		 331 aa  248  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  45.85 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  54.37 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  51.48 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  52.13 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  49.55 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  51.3 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  51.31 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  45.82 
 
 		 318 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  44.19 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  53.87 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  50.84 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  51.8 
 
 		 314 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  51.8 
 
 		 314 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  55.38 
 
 		 337 aa  235  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  51.48 
 
 		 314 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  44.22 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  60.82 
 
 		 326 aa  231  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  46.22 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  45.87 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  44.15 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  45.36 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  43.24 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  42.57 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  46 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  45.03 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 309 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  43.79 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  42.43 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  56.72 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  51.37 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 318 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  45.03 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  40.66 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  37.5 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  44.04 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  41.58 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0710  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  40.2 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  42.05 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  42.33 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  41.78 
 
 		 336 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  39 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  41.25 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  39.74 
 
 		 322 aa  206  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  43.09 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  43.23 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  39.93 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  40.63 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  37.83 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  44.6 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  41.53 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  43.81 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  40.7 
 
 		 314 aa  202  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  40.2 
 
 		 311 aa  202  8e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  41.97 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  40.35 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  40.92 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  41.58 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  41.67 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  43.55 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  39.53 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  37.42 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  37.58 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  40.46 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  40.98 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  42.76 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  39.07 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>