More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8098 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8098  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 399 aa  791    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5539  Cystathionine gamma-synthase  63.66 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.904525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24950  cystathionine gamma-synthase  57.29 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3943  cystathionine gamma-synthase  58.51 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2849  cystathionine gamma-synthase  54.69 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  42.57 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  41.06 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  41.06 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  40.6 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  38.67 
 
 		 401 aa  253  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  40.44 
 
 		 397 aa  253  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  40.2 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  40.44 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  39.8 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  39.3 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  36.63 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  39.55 
 
 		 397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  37.81 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  39.55 
 
 		 397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  39.08 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1981  cystathionine gamma-synthase  42.65 
 
 		 400 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  42.26 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  41.94 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  41.99 
 
 		 398 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  39.02 
 
 		 413 aa  242  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  39.13 
 
 		 397 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  40.4 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  42.13 
 
 		 381 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  43.32 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  41.21 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  40.05 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  38.31 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  38.31 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  38 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  38.31 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  38.31 
 
 		 392 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  38.31 
 
 		 392 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  40.42 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  38.56 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  38.56 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  37.81 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  38.06 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  39.01 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  38.58 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.35 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.38 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.38 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  40.67 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  35.18 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  36.67 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  39.37 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40.31 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  38.24 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.35 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  37.75 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  39.51 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  40.78 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.25 
 
 		 392 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  37.38 
 
 		 381 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  40.75 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.65 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  39.07 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  40.65 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  39.85 
 
 		 395 aa  222  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  41.04 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  37.56 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  40.35 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.75 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  36.88 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  40.58 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  41.09 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  34.54 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  38.67 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  38.37 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  37.59 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.07 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.46 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  39.83 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  40.1 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  38.19 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  34.3 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  39 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  35.84 
 
 		 378 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  39.88 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8009  Cystathionine gamma-lyase  42.78 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  37.59 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  38.75 
 
 		 390 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  38.19 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.76 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  38.84 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  39.32 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  37.21 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.28 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  39.26 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4838  cystathionine gamma-synthase  37.94 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.370286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  37.81 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.75 
 
 		 397 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>