More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6390 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  35.21 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  37.16 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  37.16 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  37.16 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  35.21 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  37.21 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  34.76 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  42.16 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  34.91 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  34.6 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  34.02 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  38.31 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 270 aa  99.4  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 		 321 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 1015 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  32.59 
 
 		 274 aa  95.5  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  26.43 
 
 		 271 aa  95.1  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 319 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 		 626 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 278 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 278 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 266 aa  92  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 289 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 272 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  30.35 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.42 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  25.47 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  23.4 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  26.98 
 
 		 590 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  26.34 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 1001 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 645 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  26.96 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.91 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 		 318 aa  68.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 627 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 689 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  25.6 
 
 		 357 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  40.21 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 347 aa  65.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 598 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  23.63 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  26.37 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  39.05 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  38.61 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  25.64 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.8 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  23.7 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 348 aa  61.6  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  24.28 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  23.77 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  23.7 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  34.34 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  34.34 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  34.34 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>