121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4390 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 652 aa  1326    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  36.33 
 
 		 587 aa  317  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  37.44 
 
 		 606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  34.78 
 
 		 589 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  32.75 
 
 		 610 aa  272  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  30.75 
 
 		 602 aa  267  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  27.26 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  26.58 
 
 		 592 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  27.51 
 
 		 641 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  27.55 
 
 		 589 aa  177  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  27.91 
 
 		 593 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  26.74 
 
 		 594 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  27.57 
 
 		 599 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  24.12 
 
 		 581 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  24.18 
 
 		 595 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  31.85 
 
 		 218 aa  91.3  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 248 aa  90.9  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  28.13 
 
 		 360 aa  90.5  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  29.75 
 
 		 275 aa  90.1  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  28.12 
 
 		 362 aa  89.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  23.93 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  23.75 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  23.9 
 
 		 596 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  23.67 
 
 		 576 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  23.44 
 
 		 596 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  23.44 
 
 		 589 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  22.98 
 
 		 599 aa  73.9  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  29.15 
 
 		 247 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  24.52 
 
 		 574 aa  70.5  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  27.92 
 
 		 226 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  26.18 
 
 		 504 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  23.44 
 
 		 576 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  24.05 
 
 		 668 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  21.81 
 
 		 604 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  27.6 
 
 		 239 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  23.47 
 
 		 618 aa  65.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  25.46 
 
 		 602 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  26.32 
 
 		 602 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  24.41 
 
 		 617 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  20.25 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  25.59 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  34.17 
 
 		 697 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  34.17 
 
 		 706 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  33.64 
 
 		 616 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  25.31 
 
 		 611 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3020  Rhs element Vgr protein  24.59 
 
 		 738 aa  55.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.988422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  36.67 
 
 		 320 aa  55.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  34.17 
 
 		 727 aa  55.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  22.26 
 
 		 565 aa  54.7  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1818  hypothetical protein  24.54 
 
 		 352 aa  54.7  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  26.19 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  21.34 
 
 		 645 aa  53.5  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  24.15 
 
 		 348 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  24.05 
 
 		 769 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  24.07 
 
 		 683 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  38.04 
 
 		 754 aa  52  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  25.91 
 
 		 618 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  25.73 
 
 		 615 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  29.51 
 
 		 477 aa  50.8  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  29.51 
 
 		 587 aa  50.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  23.58 
 
 		 273 aa  50.4  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  26.36 
 
 		 618 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  23.53 
 
 		 605 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  25.38 
 
 		 611 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  27.2 
 
 		 229 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  26.64 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  28.96 
 
 		 847 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  23.4 
 
 		 614 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  28.44 
 
 		 668 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  24.84 
 
 		 853 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  35.16 
 
 		 613 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  30.51 
 
 		 687 aa  48.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  30.51 
 
 		 687 aa  48.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  30.51 
 
 		 687 aa  48.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  26.09 
 
 		 1017 aa  48.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  23.54 
 
 		 771 aa  48.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  22.47 
 
 		 499 aa  47.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  24.1 
 
 		 723 aa  47.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  36.78 
 
 		 1094 aa  47.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  36.78 
 
 		 811 aa  47.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  22.57 
 
 		 678 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  26.77 
 
 		 808 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  30.51 
 
 		 706 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  23.68 
 
 		 699 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  33.7 
 
 		 692 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  28.03 
 
 		 712 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  26.58 
 
 		 851 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  25.1 
 
 		 619 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  23.11 
 
 		 668 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  25.32 
 
 		 427 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  21.65 
 
 		 616 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  34.74 
 
 		 754 aa  46.6  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  23.73 
 
 		 669 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  25 
 
 		 790 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  28.99 
 
 		 735 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  24.06 
 
 		 655 aa  45.8  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  32.97 
 
 		 852 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  33.7 
 
 		 968 aa  45.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  26.95 
 
 		 869 aa  45.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  23.16 
 
 		 646 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>