168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0625 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 437 aa  884    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7806  extracellular solute-binding protein family 1  39.69 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  40.25 
 
 		 440 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 444 aa  272  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  38.14 
 
 		 438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  24.37 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  24.37 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.08 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  31.25 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.27 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.22 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  23.09 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.66 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  25.7 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.86 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.03 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.46 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  21.87 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 495 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 451 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  21.07 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  21.7 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  28.23 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 		 417 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 493 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 442 aa  53.5  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.15 
 
 		 427 aa  53.5  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.25 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  22.41 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  29.52 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 444 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  24.3 
 
 		 437 aa  50.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 433 aa  50.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>