95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00870 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI00870  haloacid dehalogenase, putative  100 
 
 
236 aa  486  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07918  2-haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05870)  35.24 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08555  hypothetical protein  32.8 
 
 
251 aa  106  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.414826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 
234 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  23.36 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  28.07 
 
 
228 aa  62  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  25.91 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  25.14 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  25.52 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  24.44 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  29.45 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  29.45 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  25.88 
 
 
227 aa  55.5  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  27.52 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  26.28 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  27.43 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  25.17 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  30.63 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  25.88 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.35 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  27.33 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  30.28 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  23.49 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  27.52 
 
 
260 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  25.81 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  29.31 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02344  Cryptic haloacid dehalogenase 1  32.61 
 
 
123 aa  52  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.906915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  27.19 
 
 
225 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  30.84 
 
 
233 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  25.6 
 
 
234 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  24.34 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  30.13 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  24.37 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  28.08 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  26.32 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  25.52 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  30.58 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  25 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  26.97 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  28.06 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  25.17 
 
 
225 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
253 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
253 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  27.67 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  27.97 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  31.86 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  25.15 
 
 
237 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  31.19 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  27.95 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  31.53 
 
 
225 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  31.19 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  31.19 
 
 
253 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  31.4 
 
 
263 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  31.4 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  23.53 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  27.07 
 
 
255 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5695  predicted protein  31.75 
 
 
229 aa  45.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  24.78 
 
 
233 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  33.75 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  24.48 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  28.67 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  25.71 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  27.62 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  31.01 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  32.43 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  26.5 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  27.11 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  25.71 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  25.69 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  22.78 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  24.32 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.12 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  27.01 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  24.66 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2435  HAD family hydrolase  30.67 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.396573  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5761  HAD family hydrolase  30.67 
 
 
230 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  27.52 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  27.52 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2430  HAD family hydrolase  30.67 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  21.25 
 
 
227 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1819  HAD family hydrolase  30.67 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.13 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.66 
 
 
225 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  28.29 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  31.25 
 
 
224 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  23.85 
 
 
222 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  28.18 
 
 
228 aa  41.6  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>