More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00090 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI00090  farnesyltranstransferase, putative  100 
 
 		 322 aa  666    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00654  Geranylgeranyl diphosphate synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I1]  53.79 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371753 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47271  predicted protein  45.93 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08143  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase AtmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02400)  48.75 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250061  normal  0.283251 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01592  conserved hypothetical protein  45.85 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46658  geranylgeranyl diphosphate synthase  36 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.606185 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  39.93 
 
 		 933 aa  186  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02407  conserved hypothetical protein  33.44 
 
 		 675 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.54872 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02611  geranylgeranyl diphosphate synthase, putative (JCVI)  35.63 
 
 		 645 aa  109  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221  normal  0.0772164 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0319  octaprenyl-diphosphate synthase  33.63 
 
 		 347 aa  102  7e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00046336  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3242  Polyprenyl synthetase  26.05 
 
 		 354 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1537  polyprenyl synthetase family protein  27.98 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  25.38 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5159  octaprenyl-diphosphate synthase  28.98 
 
 		 322 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0320135  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  27.31 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  28.14 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  26.1 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  27.63 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  27.63 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  26.13 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  28.45 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  27.19 
 
 		 322 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  27.19 
 
 		 322 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  24.83 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  26.94 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  27.19 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  27.65 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3011  Polyprenyl synthetase  28.44 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  27.13 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  29.55 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  24.32 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.08 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  23.81 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  26.32 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  26.75 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  24.22 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  26.75 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  27.35 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  26.75 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0352  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.54 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  25.18 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  26.75 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  25.42 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  28.63 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  24.07 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.83 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  25.55 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  24.9 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3189  trans-hexaprenyltranstransferase  27.68 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  25.11 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  26.32 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  25.97 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  24.26 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  26.94 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0188  polyprenyl synthetase  29.59 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84444  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  25.11 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  30.05 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  23.4 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  25.93 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  26.72 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  24.9 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  25.64 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  24.9 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  24.24 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  26.24 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5713  Geranyltranstransferase  28 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  24.37 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  24.67 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  24.38 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  30 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  23.64 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  29.47 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2490  Polyprenyl synthetase  28.77 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  25 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  24.66 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  28.7 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  24.79 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  25.23 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  25.48 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  25.23 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  25.23 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  25.23 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  25.53 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  24.02 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  26.2 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  28.39 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  25.21 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  24.37 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  31.09 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  25.78 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  25.2 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  24.34 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  25.42 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  24.89 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  25.34 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  26.32 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  25.86 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  26.69 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  23.91 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>