120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03540 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB03540  cytoplasm protein, putative  100 
 
 		 379 aa  761    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295039  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10839  conserved hypothetical protein  36.1 
 
 		 408 aa  202  6e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.366828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70688  highly conserved oxidoreductase  33.5 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.743811 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40271  predicted protein  33.16 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44549  predicted protein  33.07 
 
 		 443 aa  153  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.425868  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30832  predicted protein  31.01 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.73505  normal  0.429862 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09356  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_3G02360)  27.53 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.809459  hitchhiker  0.00454333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  24.8 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.94 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  23.35 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  29.52 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  22.03 
 
 		 367 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  24.43 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  26.29 
 
 		 390 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 377 aa  52.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  21.72 
 
 		 376 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  27.07 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  28.72 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  28.72 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  28.72 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 819 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.41 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  21.95 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  22.37 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  28.02 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.22 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.48 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  21.96 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.48 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.22 
 
 		 369 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  22.34 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  26.83 
 
 		 419 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 365 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  20.95 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  28.72 
 
 		 458 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  22.17 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  21.68 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0669  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  21.57 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  25.49 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  21.74 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  24.29 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  21.48 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  20.9 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  21.48 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 420 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  24.7 
 
 		 364 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  21.8 
 
 		 492 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  22.55 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  21.91 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.46 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  23.13 
 
 		 960 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  20.56 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02230  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_8G05850)  33.77 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000761243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  21.31 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  20 
 
 		 817 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.85 
 
 		 838 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  19.82 
 
 		 524 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>