83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0560 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  100 
 
 		 209 aa  433  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  54.43 
 
 		 171 aa  171  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  51.81 
 
 		 186 aa  168  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  56.58 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  44.52 
 
 		 181 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  47.5 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  47.5 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  41.05 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  44.17 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  47.02 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  42.68 
 
 		 194 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  45.33 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  47.02 
 
 		 182 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  47.02 
 
 		 182 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  40.51 
 
 		 342 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  47.97 
 
 		 174 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  44.03 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  41.4 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  42.41 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  42.14 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  45.21 
 
 		 180 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  47.1 
 
 		 242 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  45.16 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  45.57 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 180 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  43.05 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  41.06 
 
 		 260 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  39.1 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  41.94 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  40 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  40.48 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  39.61 
 
 		 188 aa  118  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  37.91 
 
 		 382 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  38.51 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  37.5 
 
 		 382 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  38.93 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  34.97 
 
 		 355 aa  95.5  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  34.42 
 
 		 355 aa  95.5  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  34.46 
 
 		 404 aa  94.7  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  35.15 
 
 		 239 aa  93.2  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 344 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  31.32 
 
 		 348 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  29.15 
 
 		 360 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  33.11 
 
 		 344 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  32.69 
 
 		 346 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  34.06 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  38.76 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  38.14 
 
 		 678 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 412 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 401 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 415 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 415 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 421 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  29.07 
 
 		 304 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  29.07 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  29.07 
 
 		 304 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  28.85 
 
 		 409 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  29.07 
 
 		 304 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  32.18 
 
 		 410 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 424 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  26.74 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  26.71 
 
 		 339 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  29.29 
 
 		 327 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  27.38 
 
 		 280 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  31.46 
 
 		 126 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  28.74 
 
 		 131 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  24.68 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  24.68 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  24.68 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 417 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  25.88 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  30.56 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  23.9 
 
 		 278 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  24.42 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  28.71 
 
 		 327 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  25.88 
 
 		 278 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  27.35 
 
 		 691 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  38.1 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  31.46 
 
 		 683 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  30 
 
 		 712 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  28.72 
 
 		 337 aa  41.6  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>