More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0599 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0599  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 367 aa  729    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.329401  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0262  transcription elongation factor NusA  88.25 
 
 		 366 aa  649    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0324  transcription elongation factor NusA  69.21 
 
 		 363 aa  503  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0510  transcription elongation factor NusA  70.14 
 
 		 362 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0485  transcription elongation factor NusA  70.14 
 
 		 362 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1479  transcription elongation factor NusA  70.14 
 
 		 362 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  67.47 
 
 		 374 aa  489  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  68.12 
 
 		 365 aa  488  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0508  transcription elongation factor NusA  61.35 
 
 		 366 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.904509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1748  transcription elongation factor NusA  54.88 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  39.3 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  39.88 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  38.42 
 
 		 344 aa  202  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1262  transcription elongation factor NusA  38.17 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  37.83 
 
 		 444 aa  199  7.999999999999999e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  36.2 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01340  transcription elongation factor NusA  37.25 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  37.11 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0140  transcription elongation factor NusA  37.27 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  36.72 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1214  NusA antitermination factor  39.06 
 
 		 414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  39 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1629  transcription elongation factor NusA  38.24 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  36.42 
 
 		 503 aa  189  9e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  37.45 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  35.12 
 
 		 365 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0652  transcription elongation factor NusA  38.2 
 
 		 415 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.020983  normal  0.100842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  36.2 
 
 		 449 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  35.01 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  34.96 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  35.62 
 
 		 517 aa  184  3e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0572  NusA antitermination factor  35.28 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0763996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  39.44 
 
 		 413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  36.8 
 
 		 497 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  33.04 
 
 		 495 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1026  NusA antitermination factor  35.11 
 
 		 496 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.152945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  32.12 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  34.79 
 
 		 517 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  36.59 
 
 		 520 aa  180  4e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  33.04 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  35.82 
 
 		 534 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 501 aa  179  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  34.54 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  34.51 
 
 		 541 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 490 aa  179  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  35.01 
 
 		 516 aa  179  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  34.12 
 
 		 537 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  34.12 
 
 		 537 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  34.12 
 
 		 536 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  34.03 
 
 		 495 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  35.61 
 
 		 572 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  36.87 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  35.03 
 
 		 535 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  34.22 
 
 		 539 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  35.03 
 
 		 535 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  32.77 
 
 		 491 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  33.24 
 
 		 499 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  34.12 
 
 		 538 aa  176  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  33.98 
 
 		 492 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  35.06 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  32.49 
 
 		 491 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  33.83 
 
 		 535 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  34.81 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  35.52 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  34.35 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  32.74 
 
 		 532 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  33.92 
 
 		 540 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  33.83 
 
 		 534 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 537 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  31.86 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  34.44 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  32.96 
 
 		 491 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  33.7 
 
 		 495 aa  173  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3075  NusA antitermination factor  34.63 
 
 		 497 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  35.88 
 
 		 523 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  32.64 
 
 		 383 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  33.05 
 
 		 473 aa  172  7.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  34.53 
 
 		 491 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  33.04 
 
 		 441 aa  172  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  34.53 
 
 		 491 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  34.53 
 
 		 491 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  34.53 
 
 		 491 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  34.53 
 
 		 491 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  34.53 
 
 		 491 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  34.53 
 
 		 491 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  33.63 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4640  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0433765  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  34.43 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1421  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  31.93 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  34.02 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  33.04 
 
 		 537 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  33.43 
 
 		 506 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  31.1 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4181  transcription elongation factor NusA  30.64 
 
 		 493 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>