180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0721a on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_0721a  permease  100 
 
 		 96 aa  194  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0826  permease protein PerM, truncation  97.92 
 
 		 96 aa  187  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  93.94 
 
 		 363 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  93.94 
 
 		 363 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  69.7 
 
 		 353 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  69.7 
 
 		 353 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  69.7 
 
 		 353 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  69.7 
 
 		 353 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  69.7 
 
 		 353 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  69.7 
 
 		 353 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  69.7 
 
 		 353 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  69.7 
 
 		 353 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  69.7 
 
 		 353 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  64.71 
 
 		 362 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  69.23 
 
 		 360 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  68.12 
 
 		 361 aa  103  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  64.71 
 
 		 362 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  64.71 
 
 		 362 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  64.71 
 
 		 355 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  64.71 
 
 		 355 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  68.66 
 
 		 354 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  68.75 
 
 		 366 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  68.75 
 
 		 366 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  60.26 
 
 		 359 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  61.73 
 
 		 357 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  68.75 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  68.75 
 
 		 366 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  68.75 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  68.66 
 
 		 354 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  68.75 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  61.73 
 
 		 357 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  68.75 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  68.66 
 
 		 354 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  75 
 
 		 356 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  63.38 
 
 		 372 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  73.77 
 
 		 366 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  72.58 
 
 		 356 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  72.58 
 
 		 353 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  71.67 
 
 		 357 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  68.18 
 
 		 360 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  72.58 
 
 		 356 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  73.33 
 
 		 356 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  72.58 
 
 		 356 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  70.97 
 
 		 356 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  70.31 
 
 		 356 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  73.33 
 
 		 356 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  75 
 
 		 356 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  65.22 
 
 		 360 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  70.49 
 
 		 353 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  67.19 
 
 		 361 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  70.31 
 
 		 356 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  66.67 
 
 		 356 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  66.67 
 
 		 361 aa  97.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  72.88 
 
 		 366 aa  97.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  68.75 
 
 		 363 aa  97.1  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  75.86 
 
 		 357 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  68.85 
 
 		 350 aa  96.3  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  59.46 
 
 		 365 aa  96.7  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  71.19 
 
 		 369 aa  95.9  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  59.49 
 
 		 356 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  67.74 
 
 		 356 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  66.67 
 
 		 356 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  67.16 
 
 		 355 aa  94.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  60.27 
 
 		 357 aa  94  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  70 
 
 		 354 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  58.75 
 
 		 363 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  60.29 
 
 		 372 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  57.35 
 
 		 358 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  66.1 
 
 		 358 aa  88.6  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  59.42 
 
 		 372 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  58.57 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3323  hypothetical protein  61.54 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.283862  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  64.29 
 
 		 362 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  35.71 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  42.62 
 
 		 348 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  47.06 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  35.59 
 
 		 348 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  34.55 
 
 		 369 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  35.48 
 
 		 357 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  32.73 
 
 		 369 aa  50.1  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 		 369 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  40 
 
 		 344 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  53.85 
 
 		 346 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  43.4 
 
 		 382 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  34.78 
 
 		 354 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 		 423 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  34.43 
 
 		 343 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  37.88 
 
 		 354 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  33.93 
 
 		 338 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  34.33 
 
 		 356 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  31.82 
 
 		 353 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  36.99 
 
 		 357 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  39.22 
 
 		 434 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 345 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150  hypothetical membrane spanning protein  36.84 
 
 		 376 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  32.84 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  38.18 
 
 		 357 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  33.33 
 
 		 357 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  38.18 
 
 		 357 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>