229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02360 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02360  oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  766    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.561743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0635  FAD dependent oxidoreductase  52.73 
 
 		 370 aa  401  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1926  FAD dependent oxidoreductase  39.84 
 
 		 376 aa  292  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000171053  normal  0.0881723 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3091  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  23.72 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  22.37 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  22.45 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  21.54 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 494 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 494 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  22.75 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3421  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.135241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  21.54 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  21.45 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3765  putative oxidoreductase  24.09 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 427 aa  59.3  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  23.54 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3625  FAD dependent oxidoreductase  22.49 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  22.25 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  21.3 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1847  FAD dependent oxidoreductase  22.95 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.948299  hitchhiker  0.00800428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  22.57 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1779  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000510083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  22.37 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  21.56 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  22.06 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  23.97 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  21.89 
 
 		 437 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  19.79 
 
 		 432 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44260  putative oxidoreductase  23.65 
 
 		 436 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 431 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  22.63 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  21.9 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  21.76 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  21.37 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  22.14 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  21.83 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 453 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  22.26 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  21.49 
 
 		 462 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  21.83 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  21.04 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  21.09 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  20 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  21.52 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  21.73 
 
 		 431 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 427 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 431 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  21.52 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 427 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  20.27 
 
 		 442 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 432 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  20.48 
 
 		 435 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  21.73 
 
 		 439 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  22.06 
 
 		 427 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  22.79 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  20.95 
 
 		 434 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  21.39 
 
 		 420 aa  53.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  21.37 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  21.14 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  20.38 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  21.14 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  20.21 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1969  FAD dependent oxidoreductase  21.3 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.053713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  22.4 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.4 
 
 		 455 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  20.63 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0359  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  20.05 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  21.65 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  21.86 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  20.97 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  22.77 
 
 		 470 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  21.2 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  19.27 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  19.63 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>