More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2364 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  81.42 
 
 		 409 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 409 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  51.71 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  53.71 
 
 		 402 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  53.53 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  49.63 
 
 		 400 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  48.91 
 
 		 400 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  48.29 
 
 		 393 aa  348  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  47.1 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  47.1 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  47.1 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  47.1 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  47.1 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  47.1 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  47.1 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  47.58 
 
 		 389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  51.42 
 
 		 352 aa  335  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  50.13 
 
 		 412 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  46.86 
 
 		 386 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  45.48 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.34 
 
 		 385 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.1 
 
 		 385 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.58 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  46.19 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  47.34 
 
 		 383 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  47.34 
 
 		 383 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  47.1 
 
 		 383 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  48.2 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  47.36 
 
 		 389 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  45.69 
 
 		 395 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  47.22 
 
 		 389 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  45.35 
 
 		 393 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  46.36 
 
 		 391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  44.69 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  41.63 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  43.36 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  41.31 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  42.86 
 
 		 386 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  39.95 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  41.85 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  41.43 
 
 		 378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  40.72 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  39.61 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  40.15 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  40.1 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  39.42 
 
 		 421 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  39.42 
 
 		 421 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  42.38 
 
 		 390 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  39.52 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  38.7 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  38.69 
 
 		 366 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  39.6 
 
 		 445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  38.44 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  38.46 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  39.39 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  38.72 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  38.06 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  38.06 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  38.06 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  38.06 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  38.44 
 
 		 391 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  38.94 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  38.76 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  40.62 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  38.15 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  40.43 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  37.89 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  38.52 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  38.52 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  40.87 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  38.1 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  38.1 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  40.05 
 
 		 390 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  41.01 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  41.61 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  41.85 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  42.15 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  41.61 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  40.14 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  37.01 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  37.56 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  41.61 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  39.28 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  40.39 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  41.36 
 
 		 380 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  38.85 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  40.15 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  41.37 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  41.37 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  41.37 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  40.15 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  41.37 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  39.76 
 
 		 383 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  40.52 
 
 		 391 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  39.57 
 
 		 384 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  39.07 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  38.3 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  40.35 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  40.43 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  39.57 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>