More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0765 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  100 
 
 
266 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  91.73 
 
 
266 aa  510  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  79.47 
 
 
268 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  44.27 
 
 
265 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  42.7 
 
 
265 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  44.91 
 
 
266 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  44.27 
 
 
269 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  43.63 
 
 
273 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  44.53 
 
 
266 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  43.53 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  41.67 
 
 
259 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  41.67 
 
 
259 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  41.7 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  42.49 
 
 
281 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  44.19 
 
 
263 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  40.89 
 
 
292 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  41.98 
 
 
276 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  41.6 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  42.42 
 
 
259 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  38.77 
 
 
273 aa  185  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  40.73 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  40.67 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  41.29 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  38.83 
 
 
272 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  40.88 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  39.85 
 
 
268 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  38.81 
 
 
270 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  38.35 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  37.08 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  35.48 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  38.78 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  36.67 
 
 
278 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  38.87 
 
 
293 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  37.08 
 
 
296 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  36.13 
 
 
272 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  35.9 
 
 
272 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  38.7 
 
 
267 aa  159  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  38.41 
 
 
273 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  35.45 
 
 
287 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  36.53 
 
 
272 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  37.69 
 
 
282 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  36.47 
 
 
274 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  34.15 
 
 
272 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  37.31 
 
 
275 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  38.89 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  38.08 
 
 
278 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  36.5 
 
 
274 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  36.94 
 
 
274 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  34.3 
 
 
272 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  36.23 
 
 
265 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  35.98 
 
 
274 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  36.54 
 
 
269 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  37.17 
 
 
282 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  37.74 
 
 
266 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  36.23 
 
 
273 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 
268 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  35.45 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  36.26 
 
 
269 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  31.91 
 
 
352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  31.58 
 
 
344 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
266 aa  129  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 
352 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  31.25 
 
 
366 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 
367 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 
361 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  31.48 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  31.48 
 
 
350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  32.14 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  28 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  31.14 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  30.69 
 
 
316 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  30.42 
 
 
345 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  30.58 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  31.8 
 
 
292 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  31.29 
 
 
299 aa  118  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  32.65 
 
 
299 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  31.4 
 
 
323 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  31.77 
 
 
326 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  29.45 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  31.19 
 
 
320 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  29.5 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  30.34 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  32.21 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  32.43 
 
 
294 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  28.82 
 
 
296 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  31.29 
 
 
300 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  29.25 
 
 
332 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  29.79 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  32.65 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 
281 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  31.74 
 
 
304 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  32.29 
 
 
304 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  28.62 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  31.29 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>