265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4915 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4915  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  473  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3512  regulatory protein, LuxR  32.39 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.492486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4045  LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4356  response regulator receiver protein  31.28 
 
 		 195 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2116  LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  39.24 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  27.59 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.59 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  27.59 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.59 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.59 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.59 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.59 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.36 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  26.8 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02940  putative LuxR-family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2141  hypothetical protein  35.94 
 
 		 277 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0962248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.9 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 537 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.7 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  37.7 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.7 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1384  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2061  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.7 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2902  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 514 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  44.44 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1849  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0165336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 435 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 510 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 514 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 510 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  25.6 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2255  transcriptional regulator, LuxR family  29.77 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0543436  hitchhiker  0.000519578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  37.7 
 
 		 911 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 514 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  34.12 
 
 		 904 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.98 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 510 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  25.56 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 904 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 198 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  35.14 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5374  two component response regulator  37.29 
 
 		 779 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2088  LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 77 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1533  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 137 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.717435  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4816  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.890736  normal  0.794324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 265 aa  45.1  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.998369  normal  0.706802 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  36.92 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2606  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00642184  hitchhiker  0.00275886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>