190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1168 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  557  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  63.93 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  49.65 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  39.64 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  40.36 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  39.78 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 277 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  39.02 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  39.02 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  39.02 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  39.02 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  38.52 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  41.7 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  40.43 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  38.52 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  39.16 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  39.08 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  39.16 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  40.42 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  37.5 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  40.42 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  40.42 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  40.42 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  40.42 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  40.42 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  38.38 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  39.44 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  39.18 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  37.2 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  37.2 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  36.4 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  39.43 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  36.4 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  33.8 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  34.28 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  32.62 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  34.77 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  33.57 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  39.42 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  35 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  40.93 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  35.38 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  35.16 
 
 		 274 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  35.36 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  36.05 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  37.59 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  30.6 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  34.16 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  32.13 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  33.94 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  31.82 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  33.7 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  36.74 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  34.48 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  32.52 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  33.22 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  32.51 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  37.04 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  32.73 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  33.58 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  44.13 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  32.01 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  32.97 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  42.38 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  31.34 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  35.36 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  37.85 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  33.73 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  33.96 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  29.63 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  38.89 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  29.6 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  32.87 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  33.58 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  36.61 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  31.9 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  34.16 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  38.3 
 
 		 276 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  27.97 
 
 		 267 aa  95.9  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  30.65 
 
 		 272 aa  95.5  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  29.82 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  31.25 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  28.42 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  38.07 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  44.59 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>