202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5255 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 321 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  91.9 
 
 		 321 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  74.35 
 
 		 313 aa  474  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  70.82 
 
 		 313 aa  451  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  73.06 
 
 		 307 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  71.19 
 
 		 308 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  65.33 
 
 		 300 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  64.9 
 
 		 300 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  56.36 
 
 		 312 aa  328  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  56.38 
 
 		 297 aa  322  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  58.5 
 
 		 296 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  56.54 
 
 		 290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  34.89 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  31.97 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  30.31 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  29.18 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  29.27 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  25.87 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  30.03 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 470 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  28.03 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  28.28 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  31.4 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  29.35 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  28.72 
 
 		 323 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  28.94 
 
 		 301 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 470 aa  92.8  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  27.07 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  29.11 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  28.28 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  30.58 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  29.11 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  27.59 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  28.32 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.87 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3184  putative polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 471 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  28.62 
 
 		 364 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  28.32 
 
 		 482 aa  89.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 		 336 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  27.88 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  27.48 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  27.88 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  27.88 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  27.88 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  28.12 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  28.33 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  27.88 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  28.97 
 
 		 471 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 471 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  28.11 
 
 		 336 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  27.62 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 		 336 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  28.15 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  28.15 
 
 		 336 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  27.72 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  25.61 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  28.34 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  29.21 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  28.28 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  29.55 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  29.55 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  29.21 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  28.87 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  28.25 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  28.87 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  28.87 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  29.9 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  29.86 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  29.17 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>