More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2398 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.66 
 
 
777 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0739074  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6197  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.11 
 
 
782 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350252  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
773 aa  1575    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.28125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6478  histidine kinase  47.72 
 
 
780 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360595  normal  0.0849946 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 
782 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875574  normal  0.554031 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 
780 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297293  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5987  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 
780 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46293  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41190  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  28.72 
 
 
796 aa  189  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  26.08 
 
 
945 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  29.02 
 
 
914 aa  154  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  39 
 
 
1323 aa  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
770 aa  143  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.8 
 
 
928 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.1 
 
 
931 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  32.9 
 
 
2051 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 
989 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
841 aa  135  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  35.29 
 
 
955 aa  135  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  36.25 
 
 
1153 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.78 
 
 
929 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
1323 aa  134  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  34.41 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.41 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.82 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
937 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.41 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.41 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.41 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
721 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
989 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.82 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
984 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.82 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.82 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.82 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  34.41 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.41 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.41 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.01 
 
 
918 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.97 
 
 
906 aa  133  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
1266 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1691 aa  131  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
765 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
939 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 
1187 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.69 
 
 
952 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
927 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
631 aa  129  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.2 
 
 
927 aa  129  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
790 aa  128  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
1410 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
1178 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.36 
 
 
937 aa  128  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1333 aa  128  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  32.65 
 
 
565 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  33.06 
 
 
932 aa  127  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.65 
 
 
932 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.57 
 
 
922 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.38 
 
 
941 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
1127 aa  127  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.33 
 
 
778 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  37.21 
 
 
1257 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.33 
 
 
778 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.33 
 
 
778 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
791 aa  126  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  36.11 
 
 
781 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.76 
 
 
933 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
970 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.76 
 
 
933 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.76 
 
 
933 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.01 
 
 
929 aa  125  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.76 
 
 
932 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
936 aa  125  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.93 
 
 
1053 aa  124  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
922 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
1310 aa  124  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.89 
 
 
778 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
1765 aa  124  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
1154 aa  124  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
1058 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.89 
 
 
778 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
784 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
649 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.93 
 
 
785 aa  124  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  32.77 
 
 
923 aa  124  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.89 
 
 
778 aa  124  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
1436 aa  124  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  34.69 
 
 
810 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  31.56 
 
 
751 aa  124  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  28.14 
 
 
942 aa  124  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3384  Signal transduction histidine kinase-like  31.3 
 
 
761 aa  124  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.74 
 
 
918 aa  124  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
767 aa  124  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  32.89 
 
 
778 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.89 
 
 
778 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  34.03 
 
 
918 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.89 
 
 
778 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.89 
 
 
778 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  32.97 
 
 
1166 aa  123  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>