More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4720 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  60.85 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  58.02 
 
 		 261 aa  274  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  54.42 
 
 		 245 aa  225  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  53.33 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  53.33 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  53.33 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  53.78 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  53.78 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  52.86 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  49.55 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0825  peptidase  50.87 
 
 		 343 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0423  putative lipoprotein NlpD  50.66 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.897746  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2512  putative peptidase  50.66 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0472  putative lipoprotein NlpD  50.66 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2373  putative peptidase  51.09 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1801  putative lipoprotein NlpD  50.66 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  45.06 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0634  lipoprotein NlpD, putative  50.67 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0768696  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  39.49 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  43.11 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  43.11 
 
 		 295 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  39.42 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  40.07 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  39.05 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  39.05 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  40 
 
 		 292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  39.78 
 
 		 298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  39.78 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  39.78 
 
 		 292 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  39.78 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  39.78 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  39.78 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  39.78 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  41.49 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  41.98 
 
 		 315 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  41.92 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  37.54 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  36.93 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  41.67 
 
 		 284 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  41.2 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  42.52 
 
 		 274 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  42.25 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  35.37 
 
 		 329 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  41.63 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  42.79 
 
 		 275 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  38.76 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.74 
 
 		 322 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  37.69 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  37.69 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.74 
 
 		 322 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.74 
 
 		 322 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  35.74 
 
 		 315 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.74 
 
 		 322 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.74 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  39.26 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  35.74 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  35.77 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  38.5 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  37.35 
 
 		 318 aa  148  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  39.71 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  39.71 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  34.93 
 
 		 287 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  39.71 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  39.71 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  39.71 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  39.71 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  37.59 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  37.05 
 
 		 240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  35.36 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  40.09 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  38.43 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  40 
 
 		 289 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  38.6 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  40 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  38.68 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  34.27 
 
 		 298 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  39.51 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  39.48 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  49.58 
 
 		 331 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  40.39 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  38.02 
 
 		 299 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  37.36 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  37.06 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  36.97 
 
 		 292 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  38.16 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  37.17 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  41.46 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  38.96 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  38.96 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  48.03 
 
 		 384 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  40.69 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  38.74 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  35.47 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1995  lipoprotein  40.7 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  36.8 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  35.5 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  39.52 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  40.38 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  38.81 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>