More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1252 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  86.85 
 
 		 425 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  86.62 
 
 		 425 aa  721    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  86.62 
 
 		 425 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  100 
 
 		 424 aa  845    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  86.62 
 
 		 426 aa  726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  86.85 
 
 		 425 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  85.24 
 
 		 426 aa  709    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  88.84 
 
 		 431 aa  767    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  84.74 
 
 		 426 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  88.26 
 
 		 425 aa  723    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  89.04 
 
 		 429 aa  769    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  85.21 
 
 		 426 aa  703    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  85.48 
 
 		 426 aa  710    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  84.98 
 
 		 426 aa  715    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  85.68 
 
 		 426 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  85.21 
 
 		 426 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  75.12 
 
 		 426 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  85.21 
 
 		 426 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  76.61 
 
 		 422 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  72.33 
 
 		 435 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  72.33 
 
 		 435 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  72.13 
 
 		 432 aa  597  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  67.78 
 
 		 432 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  71.81 
 
 		 430 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  71.81 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  71.81 
 
 		 462 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  70.63 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  69.49 
 
 		 432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  64.41 
 
 		 432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  63.59 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  61.14 
 
 		 423 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  63.24 
 
 		 440 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 430 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 431 aa  265  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 430 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 430 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  37.76 
 
 		 443 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  34.53 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  33.5 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  32.26 
 
 		 453 aa  199  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 437 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 439 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.53 
 
 		 429 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  33.5 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  33.02 
 
 		 440 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 433 aa  189  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 441 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 454 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 440 aa  186  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0652  major facilitator superfamily anion(tartrate)/cation symporter  32.73 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.662228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  32.11 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  32.2 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 440 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 443 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  29.64 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 445 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5031  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 446 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  31.41 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2978  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 429 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1327  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 440 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 440 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 442 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3103  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>