89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2498 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2498  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 181 aa  345  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  28.8 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  25.19 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0760  2'-5' RNA ligase  25.58 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  30.46 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  27.32 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  27.32 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  32.4 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  24.08 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  23.48 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  26.32 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  20.97 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  21.99 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  27.94 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  21.51 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  26.46 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  27.47 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  26.56 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  21.47 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  22.68 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  24.4 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  24.26 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  20.53 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  21.98 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  20.88 
 
 		 189 aa  51.2  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  23.47 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  21.23 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  27.2 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  23.33 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1635  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  21.62 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  23.81 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  22.02 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  27.47 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  22.8 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  25.98 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  24.72 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  24.31 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  22.81 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3011  2'-5' RNA ligase  21.51 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  19.21 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  24.24 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  22.96 
 
 		 192 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  32.37 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  29.59 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  28.36 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  23.72 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  29.48 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  24.26 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  22.4 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  23.85 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  23.26 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  26.36 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  23.57 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  22.9 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  25.39 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  24.56 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.9 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.65 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  27.81 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.82 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  28.82 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  28.82 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  24.6 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  24.59 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  28.09 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  26.5 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  27.42 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  19.54 
 
 		 190 aa  44.3  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  22.94 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  24.82 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  22.45 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  31.34 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.57 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  21.77 
 
 		 174 aa  42  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  21.76 
 
 		 178 aa  42  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27110  2'-5' RNA ligase  20.61 
 
 		 182 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  26.32 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  22.42 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  24.4 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  21.69 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>