More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2092 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 670 aa  1369    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 634 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 662 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  31.24 
 
 		 646 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 673 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  30.67 
 
 		 671 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 655 aa  262  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  29.32 
 
 		 695 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  31.7 
 
 		 638 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 642 aa  253  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 656 aa  252  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 714 aa  237  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  31.15 
 
 		 623 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 680 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 634 aa  212  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 682 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 625 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 626 aa  204  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.38 
 
 		 614 aa  203  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 626 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 641 aa  194  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.22 
 
 		 613 aa  193  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  28.03 
 
 		 671 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  29.19 
 
 		 611 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  29.74 
 
 		 617 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 611 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 659 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 624 aa  182  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  26.73 
 
 		 638 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 618 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 615 aa  177  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 634 aa  177  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.79 
 
 		 615 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 645 aa  171  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.66 
 
 		 614 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 602 aa  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 612 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.35 
 
 		 614 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.35 
 
 		 614 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.35 
 
 		 614 aa  163  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.19 
 
 		 614 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.69 
 
 		 615 aa  158  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 698 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 616 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 627 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.27 
 
 		 631 aa  154  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 624 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.77 
 
 		 614 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.06 
 
 		 619 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  25.64 
 
 		 661 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.85 
 
 		 631 aa  152  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 638 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.31 
 
 		 614 aa  151  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.31 
 
 		 614 aa  151  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.15 
 
 		 614 aa  150  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.15 
 
 		 614 aa  150  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.46 
 
 		 614 aa  150  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 614 aa  148  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.01 
 
 		 616 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 690 aa  147  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 627 aa  147  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 635 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 647 aa  141  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.31 
 
 		 631 aa  140  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  25.16 
 
 		 611 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 619 aa  140  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 611 aa  139  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.33 
 
 		 613 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 629 aa  138  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 627 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  26.02 
 
 		 623 aa  137  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.93 
 
 		 653 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.65 
 
 		 631 aa  135  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 613 aa  135  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 638 aa  134  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.18 
 
 		 1023 aa  133  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  27.27 
 
 		 621 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 642 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 624 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 649 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 742 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  26.36 
 
 		 680 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 628 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 736 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 642 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 642 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 642 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25.28 
 
 		 628 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 735 aa  124  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 614 aa  124  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 699 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.44 
 
 		 695 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 627 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1684  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 668 aa  122  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 613 aa  122  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>