More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29090 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  784    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  67.1 
 
 		 380 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  65.27 
 
 		 382 aa  501  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  64.58 
 
 		 381 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  61.56 
 
 		 384 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  63.42 
 
 		 384 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  62.6 
 
 		 384 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  60.68 
 
 		 386 aa  485  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  62.34 
 
 		 387 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  60.98 
 
 		 389 aa  478  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  59.43 
 
 		 389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  58.44 
 
 		 383 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  58.07 
 
 		 383 aa  461  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  59.13 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  60.16 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  55.91 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  54.86 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  55.38 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  54.86 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  52.97 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  52.84 
 
 		 387 aa  408  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  53.91 
 
 		 381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  52.32 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  33.8 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  32.39 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.7 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  31.92 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  28.93 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  31.4 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.26 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  32.22 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  23.01 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.84 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  23.71 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.27 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  24.47 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  26.44 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  23.67 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  25.93 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.31 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.12 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  23.41 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>