More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09540 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 		 280 aa  544  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  58.33 
 
 		 372 aa  195  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  38.61 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  46.03 
 
 		 278 aa  98.6  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 204 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  35.32 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.36 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  41.9 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.69 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  50 
 
 		 378 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 150 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  47.13 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  46.24 
 
 		 378 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  35.82 
 
 		 368 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  51.16 
 
 		 372 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  51.16 
 
 		 372 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  51.16 
 
 		 372 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  44.34 
 
 		 400 aa  89  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.34 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 476 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 271 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  49.46 
 
 		 348 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  45.36 
 
 		 205 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 150 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.72 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  38.05 
 
 		 1048 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  46.3 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47.25 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  37.12 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  41.23 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  43.88 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  51.14 
 
 		 524 aa  82.8  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.76 
 
 		 635 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.67 
 
 		 372 aa  82.4  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 535 aa  82.4  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  41.74 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  43.16 
 
 		 348 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  43.16 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  45 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  36.88 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  48.68 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  38.36 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  31.53 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  45.26 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  43.16 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  43.01 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  42.53 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.75 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  35.76 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.15 
 
 		 556 aa  79.3  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  42.11 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.89 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  37.37 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  40 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  37.27 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  44.58 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  46.51 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  34.39 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  38.98 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  45.36 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  34.4 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  32.26 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  29.87 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.99 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.43 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.59 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  36.94 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  43.56 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>