More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5237 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  95.4 
 
 		 522 aa  996    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  94.64 
 
 		 522 aa  992    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  97.13 
 
 		 522 aa  1013    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  97.13 
 
 		 522 aa  1012    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  96.93 
 
 		 522 aa  1008    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  97.13 
 
 		 522 aa  1013    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  97.13 
 
 		 522 aa  1013    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  94.25 
 
 		 522 aa  964    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  100 
 
 		 522 aa  1037    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  94.06 
 
 		 522 aa  966    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  59.07 
 
 		 519 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  53.19 
 
 		 530 aa  561  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  54.27 
 
 		 549 aa  555  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  52.22 
 
 		 533 aa  555  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  54.47 
 
 		 528 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  53.11 
 
 		 561 aa  552  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  51.61 
 
 		 554 aa  549  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  52.88 
 
 		 539 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  52.82 
 
 		 524 aa  541  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  51.11 
 
 		 534 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  51.5 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  49 
 
 		 519 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  48.01 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  47.41 
 
 		 516 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  46.17 
 
 		 555 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  47.7 
 
 		 518 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  45.19 
 
 		 529 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  43.53 
 
 		 537 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  38.08 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  40.72 
 
 		 516 aa  342  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  40.37 
 
 		 518 aa  326  8.000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  34.48 
 
 		 551 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  49.12 
 
 		 341 aa  277  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  36.01 
 
 		 503 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  33.96 
 
 		 659 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  34.67 
 
 		 520 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  34.87 
 
 		 550 aa  260  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  34.67 
 
 		 520 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  33.54 
 
 		 659 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  32.44 
 
 		 535 aa  253  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  36.83 
 
 		 498 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  33.46 
 
 		 538 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  34 
 
 		 657 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  32.22 
 
 		 545 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  33.93 
 
 		 526 aa  250  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  32.99 
 
 		 506 aa  250  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  33.48 
 
 		 637 aa  249  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  31.13 
 
 		 530 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  32.73 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  33.92 
 
 		 523 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  31.54 
 
 		 573 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  33.13 
 
 		 516 aa  246  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  32.93 
 
 		 516 aa  246  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  31.52 
 
 		 490 aa  246  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  34.11 
 
 		 504 aa  246  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  32.93 
 
 		 516 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  32.93 
 
 		 516 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  32.73 
 
 		 516 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  31.5 
 
 		 494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  32.93 
 
 		 516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  33.04 
 
 		 667 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  31.88 
 
 		 542 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  30.36 
 
 		 600 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  32.73 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  32.73 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  31.76 
 
 		 532 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  31.26 
 
 		 606 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  32.76 
 
 		 681 aa  240  5e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  29.55 
 
 		 556 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  32 
 
 		 661 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  29.85 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  33.86 
 
 		 567 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  31.17 
 
 		 584 aa  237  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  31.81 
 
 		 656 aa  237  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  30.19 
 
 		 538 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  33.12 
 
 		 505 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  31.85 
 
 		 553 aa  236  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  31.21 
 
 		 516 aa  236  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  32.03 
 
 		 681 aa  236  9e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  31.83 
 
 		 611 aa  236  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  33.41 
 
 		 653 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 505 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  32.91 
 
 		 505 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  32.91 
 
 		 505 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  33.41 
 
 		 505 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  31.34 
 
 		 523 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  32.87 
 
 		 526 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  32.91 
 
 		 505 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  32.91 
 
 		 505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  32.91 
 
 		 504 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  31.91 
 
 		 526 aa  234  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2323  glycine betaine transporter  34.06 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100678  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  32.91 
 
 		 504 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  31.37 
 
 		 603 aa  232  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  32.74 
 
 		 671 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  31.8 
 
 		 661 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  31.85 
 
 		 644 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1282  transporter, BCCT family  31.13 
 
 		 534 aa  231  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  31.56 
 
 		 554 aa  231  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  30.37 
 
 		 529 aa  230  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>