More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3807 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3807  ABC transporter related  100 
 
 		 354 aa  660    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04180  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  64.78 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.40669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0180  ABC transporter related protein  57.73 
 
 		 352 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0748  ABC transporter related  56.82 
 
 		 333 aa  285  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0316  ABC transporter related  53.91 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.000000000465057  decreased coverage  0.0034539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  50 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0435  ABC transporter related  52.62 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  46.53 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3054  ABC transporter related protein  56.69 
 
 		 337 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.374773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  43.71 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  52.94 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  42.74 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  42.74 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  42.74 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  43.71 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  41.72 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.19 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  36.94 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  35.76 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  40.11 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  50.78 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  52.7 
 
 		 354 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  37.75 
 
 		 343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.95 
 
 		 356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 		 343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  43.94 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  41.87 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  37.18 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  45.59 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.61 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  54.08 
 
 		 257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.94 
 
 		 359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  47.01 
 
 		 527 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.57 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  47.11 
 
 		 353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  48.93 
 
 		 342 aa  213  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  45.77 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  44.1 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  51.42 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.96 
 
 		 352 aa  212  9e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  43.92 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.13 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  31.94 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  49.1 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4066  ABC transporter related  45.49 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549495  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  50.62 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.61 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  50.88 
 
 		 348 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  46.26 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  39.81 
 
 		 368 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  50.23 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  51.52 
 
 		 410 aa  209  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.91 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  47.41 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.18 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.84314  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  44.36 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  51.25 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50.91 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  41.06 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  51.25 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2478  thiamine transport system ATP-binding protein  41.6 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  51.25 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  51.25 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.14 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  44.28 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.28 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  44.28 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.07 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.07 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.84 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  47.06 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  51.67 
 
 		 257 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  44.53 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  43 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1768  ABC transporter related  38.59 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  48.1 
 
 		 359 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.91 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  45.95 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4252  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 		 367 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.96 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 351 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.69 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  33.22 
 
 		 352 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.91 
 
 		 377 aa  205  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  36.64 
 
 		 350 aa  205  9e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>