More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0435 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0435  ABC transporter related  100 
 
 
332 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  52.21 
 
 
348 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0748  ABC transporter related  53.33 
 
 
333 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0316  ABC transporter related  55.51 
 
 
342 aa  255  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.000000000465057  decreased coverage  0.0034539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04180  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  56.64 
 
 
379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.40669  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3807  ABC transporter related  52.31 
 
 
354 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  45.67 
 
 
328 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.81 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3054  ABC transporter related protein  50 
 
 
337 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.374773  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0180  ABC transporter related protein  62.33 
 
 
352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  40.84 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.75 
 
 
377 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.75 
 
 
377 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  41.02 
 
 
329 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.75 
 
 
377 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  49.17 
 
 
377 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.17 
 
 
377 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
377 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  49.17 
 
 
377 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
377 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
377 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
377 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.69 
 
 
378 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 
377 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.33 
 
 
377 aa  229  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.33 
 
 
377 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.33 
 
 
377 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.92 
 
 
378 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.75 
 
 
377 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.91 
 
 
378 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.02 
 
 
329 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  40.53 
 
 
336 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  47.92 
 
 
377 aa  225  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  47.5 
 
 
400 aa  225  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  48.82 
 
 
348 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.12 
 
 
375 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.61 
 
 
363 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.81 
 
 
377 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  46.15 
 
 
356 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  39.64 
 
 
336 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.08 
 
 
387 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  49.81 
 
 
342 aa  223  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  45.51 
 
 
361 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  43.42 
 
 
331 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.32 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  40.84 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0220  ABC transporter related protein  60.87 
 
 
389 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275345  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.56 
 
 
371 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.08 
 
 
390 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3008  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 
378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.532484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.42 
 
 
331 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0347  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.06 
 
 
384 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  46.48 
 
 
353 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5239  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.47 
 
 
380 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.52 
 
 
356 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
386 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.69 
 
 
372 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 
380 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.67 
 
 
380 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 
378 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 
378 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 
378 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2120  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
380 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674614  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  45.9 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
386 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.86 
 
 
380 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.47 
 
 
380 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.04 
 
 
386 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  49.58 
 
 
350 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.25 
 
 
378 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.25 
 
 
378 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.25 
 
 
378 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  50 
 
 
346 aa  215  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  45.72 
 
 
351 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  50.43 
 
 
388 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.28 
 
 
363 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  40.24 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  50.21 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.67 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  50.21 
 
 
379 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  46.64 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  42.35 
 
 
387 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  45.64 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  45.08 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.33 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.33 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  46.77 
 
 
365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.33 
 
 
384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.13 
 
 
370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  49.33 
 
 
384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  49.33 
 
 
384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>