More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3757 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  100 
 
 
154 aa  293  6e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  53.73 
 
 
144 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  53.44 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
137 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 
137 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 
136 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  49.31 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
141 aa  104  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  51.13 
 
 
137 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 
142 aa  100  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  49.64 
 
 
136 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  50 
 
 
139 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  42.34 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  46.02 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  42.96 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 
398 aa  88.2  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  49.23 
 
 
136 aa  87.8  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  47.26 
 
 
149 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  45.11 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  42.96 
 
 
399 aa  80.9  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  43.36 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  43.36 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  44.7 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  52.33 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  39.73 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  32.31 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
132 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  36.04 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  39.13 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  42.62 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  30.95 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  28.1 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  28.1 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  28.1 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  38.89 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  28.1 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  35.62 
 
 
153 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  28.1 
 
 
153 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
156 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  35.62 
 
 
153 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  50.79 
 
 
144 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  28.1 
 
 
153 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  38 
 
 
146 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.59 
 
 
137 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  35.62 
 
 
229 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  31.01 
 
 
320 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  41.76 
 
 
313 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.24 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 
169 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  30.17 
 
 
524 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.7 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  39.33 
 
 
316 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  35.71 
 
 
329 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  30.77 
 
 
136 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.65 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  35.71 
 
 
329 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  35.03 
 
 
318 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.75 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  34.43 
 
 
316 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  38.2 
 
 
314 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  40.21 
 
 
130 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.06 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>