161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0342 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 302 aa  580  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  41.52 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  41.38 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.77 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  28.33 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  32.85 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  34.98 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  26.4 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  30.39 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.95 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  29.11 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  33.49 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.24 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21070  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  35.93 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  21.79 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  31.5 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.92 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.51 
 
 		 677 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  33.66 
 
 		 1093 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4747  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  29.15 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0540439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1477  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  30.22 
 
 		 1054 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.438417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.74 
 
 		 327 aa  52.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  26.44 
 
 		 395 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  28.14 
 
 		 322 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  25.89 
 
 		 743 aa  52.8  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.96 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  23.93 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.86 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  22.07 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3743  carbamoyl phosphate synthase large subunit  39.47 
 
 		 1112 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0558638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1864  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.06 
 
 		 1082 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000611023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  29.76 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  22.07 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  22.07 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.95 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  41.11 
 
 		 862 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3012  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  37 
 
 		 1107 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.541011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  30.96 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2688  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  34.08 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3198  carbamoyl phosphate synthase large subunit  38.89 
 
 		 1130 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00397433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.75 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2664  carbamoyl phosphate synthase large subunit  40.28 
 
 		 1112 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  45.71 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  25.08 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  26.98 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3102  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  37.5 
 
 		 1100 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  21.6 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2572  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  26.67 
 
 		 1073 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0164695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  39.56 
 
 		 871 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11413  carbamoyl phosphate synthase large subunit  37.5 
 
 		 1115 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00750159  normal  0.0530566 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.55 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18000  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  37.5 
 
 		 1107 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.77035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  22.07 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1774  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.16 
 
 		 1081 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000157385  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  34.97 
 
 		 856 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.11 
 
 		 343 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  27.69 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.78 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  28.43 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0708  RimK domain protein ATP-grasp  32.05 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3089  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  48.21 
 
 		 425 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000498843  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  26.51 
 
 		 356 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15590  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  36.11 
 
 		 1111 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.63 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.35 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  34.74 
 
 		 410 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.46 
 
 		 1076 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2340  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  36.36 
 
 		 1110 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.71 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3458  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.91 
 
 		 1071 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3153  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  36.49 
 
 		 1105 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  45.45 
 
 		 879 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  32.16 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.66 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2367  carbamoyl phosphate synthase large subunit  38.89 
 
 		 1112 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.817973  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.84 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2414  carbamoyl phosphate synthase large subunit  38.89 
 
 		 1112 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271398  normal  0.318582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  26.58 
 
 		 420 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  32.3 
 
 		 890 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2408  carbamoyl phosphate synthase large subunit  38.89 
 
 		 1112 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.415819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1967  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.1 
 
 		 1076 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2639  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24 
 
 		 1105 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  23.6 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0085  carbamoylphosphate synthase large subunit  35.62 
 
 		 1127 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1276  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.99 
 
 		 1081 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.62 
 
 		 1082 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.72 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  37.29 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.95 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5241  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  35.53 
 
 		 1099 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560222  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.75 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  23.2 
 
 		 403 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0243  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  22.34 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1057  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  36.11 
 
 		 1103 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.614826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2431  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  43.4 
 
 		 1143 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  28.69 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2405  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  36.11 
 
 		 1099 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  36.67 
 
 		 855 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0660  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.45 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.127556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  26.07 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>