More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0801 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  94.02 
 
 		 251 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  94.02 
 
 		 251 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  93.63 
 
 		 251 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  93.23 
 
 		 251 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  78.88 
 
 		 267 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  71.31 
 
 		 251 aa  338  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  66.93 
 
 		 251 aa  325  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  64.8 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 251 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  60.56 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  62.95 
 
 		 251 aa  279  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  50.4 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  51.6 
 
 		 252 aa  231  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  49.6 
 
 		 251 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  57.01 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  53.82 
 
 		 250 aa  221  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  46.22 
 
 		 251 aa  204  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  40.83 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  38.55 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  34.68 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  40.56 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  40.32 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  39.27 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  37.15 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  32.52 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  37.35 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  34.68 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  35.09 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  36.52 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  37.89 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  34.66 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  35 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  35.65 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  37.44 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  40.34 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  34.96 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  37.4 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  33.96 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  36.72 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.8 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 315 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  37.79 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 376 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  35.78 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  34.03 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.8 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  31.74 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  35.55 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  38.21 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  36.08 
 
 		 255 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  34.46 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.85 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8218  transcriptional regulator, DeoR family  36.61 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  32.03 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  32.03 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  33.89 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>