60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0636 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  100 
 
 		 765 aa  1548    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1109  hypothetical protein  48.21 
 
 		 645 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2894  lectin repeat domain protein  37.2 
 
 		 801 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.106224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2698  Ricin B lectin  37.79 
 
 		 803 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0894708  normal  0.0551726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  27.62 
 
 		 1022 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  34.27 
 
 		 855 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  31.62 
 
 		 848 aa  107  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  26.7 
 
 		 1027 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  35.42 
 
 		 972 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  31.43 
 
 		 848 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  58.93 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 		 868 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  31.54 
 
 		 868 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 		 868 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  24.48 
 
 		 653 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  30.09 
 
 		 868 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  24.16 
 
 		 653 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  27.6 
 
 		 600 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  30.87 
 
 		 868 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  31.25 
 
 		 867 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  24.16 
 
 		 653 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  29.65 
 
 		 868 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  33.33 
 
 		 861 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  40.51 
 
 		 727 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  28.75 
 
 		 869 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  26.25 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02195  chitinase  33.96 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  26.88 
 
 		 594 aa  67.4  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 863 aa  64.3  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  30.48 
 
 		 1057 aa  63.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  32.95 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  34.13 
 
 		 699 aa  61.6  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  29.41 
 
 		 1393 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  31.01 
 
 		 3278 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  29 
 
 		 1107 aa  58.5  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  40.26 
 
 		 729 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  24.68 
 
 		 985 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  40.26 
 
 		 729 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  27.27 
 
 		 1393 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  55.81 
 
 		 402 aa  52  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  25.19 
 
 		 582 aa  51.6  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  28.12 
 
 		 571 aa  51.2  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.17 
 
 		 1750 aa  51.2  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  32.08 
 
 		 1204 aa  50.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  48.94 
 
 		 772 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  27.64 
 
 		 591 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  31.52 
 
 		 833 aa  48.5  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4369  hypothetical protein  35 
 
 		 646 aa  47.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  35 
 
 		 1916 aa  46.6  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  28.42 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  29.84 
 
 		 1011 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  32.2 
 
 		 565 aa  45.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  35.45 
 
 		 1258 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  30.48 
 
 		 553 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  30.48 
 
 		 587 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  30.48 
 
 		 587 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  30.48 
 
 		 587 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  33.04 
 
 		 1265 aa  45.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  30.48 
 
 		 587 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  45.24 
 
 		 395 aa  44.3  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>