12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2698 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2894  lectin repeat domain protein  79.78 
 
 		 801 aa  1341    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.106224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2698  Ricin B lectin  100 
 
 		 803 aa  1672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0894708  normal  0.0551726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  37.79 
 
 		 765 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1109  hypothetical protein  39.16 
 
 		 645 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  25.77 
 
 		 1022 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  24.78 
 
 		 653 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  25.29 
 
 		 1027 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  24.28 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  24.28 
 
 		 653 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  23.91 
 
 		 560 aa  51.6  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  22.67 
 
 		 594 aa  45.8  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  30.07 
 
 		 601 aa  44.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>