13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4369 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4369  hypothetical protein  100 
 
 
646 aa  1224    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  51.7 
 
 
1040 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  32.55 
 
 
1027 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  27.66 
 
 
1022 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0282  hypothetical protein  28.61 
 
 
767 aa  80.5  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.14346 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  29.34 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  27.42 
 
 
601 aa  75.5  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  31.28 
 
 
594 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  32.89 
 
 
653 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  32.89 
 
 
653 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  32.42 
 
 
653 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  34.4 
 
 
582 aa  58.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  34.57 
 
 
765 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>