166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5734 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  95.91 
 
 		 416 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  95.19 
 
 		 416 aa  808    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  98.56 
 
 		 416 aa  835    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  95.19 
 
 		 416 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  91.83 
 
 		 416 aa  782    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  95.66 
 
 		 416 aa  810    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  100 
 
 		 416 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  61.39 
 
 		 418 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  55.61 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  46.17 
 
 		 423 aa  352  8.999999999999999e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  45.37 
 
 		 416 aa  332  8e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  43.49 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  42.92 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  48.24 
 
 		 411 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  43.65 
 
 		 411 aa  292  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  39.38 
 
 		 425 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  43.98 
 
 		 412 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  43.84 
 
 		 434 aa  289  7e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  44.21 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  40.24 
 
 		 410 aa  287  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  43.54 
 
 		 416 aa  285  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  42.42 
 
 		 429 aa  279  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  41.02 
 
 		 408 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  41.6 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  42.42 
 
 		 416 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  41.42 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  42.03 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  41.76 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  42.35 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  39.63 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  42.31 
 
 		 412 aa  259  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  38.32 
 
 		 422 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  41.58 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  36.84 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  44.98 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  38.4 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  36.78 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  34.18 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  33.82 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  33.12 
 
 		 432 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  35.21 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  28.29 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  33.82 
 
 		 413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  32.8 
 
 		 432 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  32.48 
 
 		 413 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  33.09 
 
 		 432 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  32.17 
 
 		 413 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  33.45 
 
 		 413 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  30.1 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  30.1 
 
 		 436 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  35.02 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  32.01 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  33.91 
 
 		 398 aa  150  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  32.17 
 
 		 398 aa  149  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  32.17 
 
 		 398 aa  149  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  32.28 
 
 		 420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  32.12 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.86 
 
 		 465 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  36.88 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  31.58 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  40.34 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  34.23 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  35.02 
 
 		 464 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  26.09 
 
 		 407 aa  132  9e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  35.87 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.43 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.08 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  26.13 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  24.81 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27.51 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.12 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  27.69 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  28.67 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  27.27 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  25.66 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  27.04 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  25.41 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  22.44 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.52 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  26.8 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  28.63 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  25.33 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  25.08 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  25 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  25.33 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  26.09 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  25.09 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  24.78 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  25.29 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  24.55 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  23.36 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  32.71 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  23.51 
 
 		 390 aa  57  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  23.99 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  25.17 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3342  DNA repair exonuclease-like protein  29.85 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.952092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  25.08 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  23.83 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  22.33 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  24.16 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>