More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1214 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 333 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  78.26 
 
 		 342 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  78.06 
 
 		 338 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  76.8 
 
 		 338 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  56.31 
 
 		 333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  51.63 
 
 		 331 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  49.53 
 
 		 329 aa  262  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  41.99 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  42.42 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  39.38 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  42.06 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  47.45 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  41.8 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  45.32 
 
 		 352 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  43.25 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  42.29 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  40.82 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  42.36 
 
 		 335 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  41.33 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.18 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  35.46 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.75 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.75 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  39.31 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.31 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.31 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.97 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.97 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.97 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.62 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.79 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.29 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.34 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.34 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  32.34 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.34 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  32.34 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  35.65 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 345 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  36.92 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.9 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  33.84 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  33.84 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  35.66 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  33.53 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.2 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  34.56 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 309 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  32.9 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.07 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.04 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.37 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 		 320 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  36.72 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  33.11 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 332 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.59 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  35.06 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  33.88 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.06 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  33.45 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  35.32 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  32.86 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 835 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  33.74 
 
 		 330 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.924695 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  31.12 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  32.86 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  33.74 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  30.33 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>