More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1404 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1628  transketolase, C-terminal subunit  100 
 
 		 303 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2568  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1404  transketolase, C-terminal subunit  100 
 
 		 303 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2130  transketolase, C-terminal subunit  100 
 
 		 303 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.963697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3184  transketolase, C-terminal subunit  100 
 
 		 303 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2515  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2655  transketolase, C-terminal subunit  99.34 
 
 		 303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1963  transketolase, C-terminal subunit  90.33 
 
 		 302 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.686485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  34.67 
 
 		 319 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  35.31 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  33.12 
 
 		 321 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  31.83 
 
 		 342 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  29.05 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  31.6 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  33.22 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  31.94 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  29.74 
 
 		 322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  29.04 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  31.68 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  34.2 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  30.1 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  30.1 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  33.11 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  30.23 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  30.23 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  29.97 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  28.48 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  35.27 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  32.43 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  29.05 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  29.7 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  28.81 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  30 
 
 		 327 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  29.7 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  29.24 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  29 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  34.1 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  28.86 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  31.97 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  33.79 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  28.33 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  26.57 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  31.23 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  30.33 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  29.24 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  33.79 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  31.1 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  30.07 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  27.06 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  31.68 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  28.85 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  30.91 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  29.66 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2584  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.49 
 
 		 633 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.931562  normal  0.224926 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  27.42 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  31.79 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  32.41 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  31.07 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  28.67 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  28.33 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  32.79 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  30.69 
 
 		 298 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  31.38 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  32.73 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  29.86 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  28.72 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  32.03 
 
 		 347 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  29.08 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  30.82 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  29.71 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  29.51 
 
 		 592 aa  112  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  27.3 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  33.33 
 
 		 334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  27.04 
 
 		 635 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  29.83 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  32.88 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  28.38 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  30.77 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  25.58 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  30.98 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  31.15 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  29.87 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  30 
 
 		 621 aa  108  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  26.71 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  30.94 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  29.02 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  27.49 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  29.9 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1764  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30 
 
 		 626 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0479282  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  30.56 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1018  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.57 
 
 		 637 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1393  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.8 
 
 		 633 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.440641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  31.42 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  26.07 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  26.82 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  30.16 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  30.94 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  29.35 
 
 		 324 aa  105  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1540  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.24 
 
 		 620 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00810208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  29.96 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>