145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6234 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6234  putative collagen-like protein  100 
 
 		 180 aa  345  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  64.1 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2472  triple helix repeat-containing collagen  47.65 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1937  triple helix repeat-containing collagen  51.41 
 
 		 219 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  55.84 
 
 		 689 aa  86.3  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  58.89 
 
 		 2914 aa  80.9  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  54.32 
 
 		 1101 aa  75.1  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  46.3 
 
 		 2851 aa  69.3  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  59.49 
 
 		 400 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  58.44 
 
 		 842 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  57.14 
 
 		 283 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  60.56 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  52.81 
 
 		 437 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  50.63 
 
 		 585 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  52.81 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  48.19 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  39.31 
 
 		 712 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  55.68 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  52.5 
 
 		 582 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  55 
 
 		 643 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  46.25 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  48.72 
 
 		 481 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  50.65 
 
 		 813 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  48.72 
 
 		 478 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  46.25 
 
 		 258 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  47.37 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  54.76 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  50.65 
 
 		 706 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  51.39 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  47.37 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  45.83 
 
 		 580 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  58.33 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  51.35 
 
 		 468 aa  62.8  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  49.48 
 
 		 542 aa  62.8  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  44.16 
 
 		 459 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 466 aa  62  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  55.56 
 
 		 953 aa  62  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  46.25 
 
 		 347 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  46.25 
 
 		 347 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  53.25 
 
 		 434 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  46.91 
 
 		 492 aa  61.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  45.78 
 
 		 606 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  49.38 
 
 		 587 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  51.69 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  55 
 
 		 835 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  45.71 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  43.42 
 
 		 644 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  47.3 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  47.3 
 
 		 1426 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  51.81 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  47.5 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  52.5 
 
 		 512 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  52.17 
 
 		 451 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  52.94 
 
 		 437 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  42.5 
 
 		 524 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  47.31 
 
 		 951 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  41.1 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  52.94 
 
 		 437 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  59.7 
 
 		 839 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  37.33 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  53.75 
 
 		 835 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  55.84 
 
 		 934 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  41.67 
 
 		 426 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  57.14 
 
 		 1321 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  37.66 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  46.43 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  44.29 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  47.44 
 
 		 936 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  49.46 
 
 		 835 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  39.29 
 
 		 462 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  43.75 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  41.56 
 
 		 815 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  40.26 
 
 		 469 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  47.56 
 
 		 582 aa  55.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  46.75 
 
 		 838 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  51.76 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  50.7 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  45.65 
 
 		 748 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  54.43 
 
 		 767 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  52.17 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  46.74 
 
 		 1297 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  48.19 
 
 		 1168 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  38.03 
 
 		 369 aa  54.3  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1977 aa  54.3  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  45.68 
 
 		 1147 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  40 
 
 		 647 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  52.81 
 
 		 1873 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  31.3 
 
 		 252 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  51.95 
 
 		 1170 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  42.86 
 
 		 1055 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  43.66 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  44.83 
 
 		 348 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1402  Collagen triple helix repeat protein  57.38 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  37.5 
 
 		 445 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  52.5 
 
 		 867 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  41.56 
 
 		 285 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  42.5 
 
 		 639 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  43.48 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  40 
 
 		 1219 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>