More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  45.54 
 
 
814 aa  687    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  67.13 
 
 
789 aa  1082    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  76.93 
 
 
806 aa  1253    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  100 
 
 
807 aa  1666    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  64.57 
 
 
808 aa  1053    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  81.4 
 
 
798 aa  1316    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  54.26 
 
 
799 aa  856    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  74.94 
 
 
795 aa  1232    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  49.64 
 
 
815 aa  783    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  85.31 
 
 
812 aa  1410    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  39.21 
 
 
802 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  44.94 
 
 
732 aa  555  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  40.49 
 
 
816 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  38.97 
 
 
819 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  39.43 
 
 
833 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  38.7 
 
 
812 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  39.32 
 
 
803 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  37.3 
 
 
801 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  37.16 
 
 
803 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  37.66 
 
 
827 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  38.67 
 
 
766 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 
824 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  34.46 
 
 
817 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  39.44 
 
 
723 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  36.51 
 
 
840 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  35.33 
 
 
831 aa  438  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 
803 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  34.66 
 
 
810 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  35.93 
 
 
753 aa  432  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  35.79 
 
 
753 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 
844 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  32.89 
 
 
826 aa  426  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  33.95 
 
 
802 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.34 
 
 
825 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  37.77 
 
 
723 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  35.97 
 
 
722 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.83 
 
 
747 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  33.88 
 
 
714 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 
822 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  35.03 
 
 
699 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  36.57 
 
 
722 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  33.22 
 
 
841 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 
735 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 
717 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 
696 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  38.03 
 
 
724 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 
841 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 
830 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 
748 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 
840 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  36.45 
 
 
741 aa  389  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 
822 aa  389  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.87 
 
 
728 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  34.7 
 
 
723 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.77 
 
 
724 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.77 
 
 
724 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 
747 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.55 
 
 
729 aa  385  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 
740 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.77 
 
 
724 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  35.8 
 
 
765 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 
731 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.77 
 
 
724 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 
722 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.77 
 
 
724 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.26 
 
 
729 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 
729 aa  382  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  35.53 
 
 
765 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.26 
 
 
729 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.26 
 
 
729 aa  382  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 
733 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.26 
 
 
729 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 
747 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
693 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  33.18 
 
 
693 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.97 
 
 
729 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  34.26 
 
 
729 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  35.53 
 
 
765 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 
741 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  34.7 
 
 
729 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.26 
 
 
729 aa  382  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 
741 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  33.8 
 
 
722 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  33.21 
 
 
821 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 
828 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 
722 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 
737 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 
825 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 
703 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 
800 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 
746 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 
720 aa  362  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 
725 aa  362  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 
828 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 
730 aa  357  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
737 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 
738 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 
826 aa  355  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 
738 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 
727 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.117694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>