More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10000 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_10000  short chain dehydrogenase  100 
 
 
251 aa  487  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  57.36 
 
 
281 aa  276  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  54.83 
 
 
278 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 
266 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  29.69 
 
 
269 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 
291 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 
294 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 
294 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
264 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12160  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 
293 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.223019  normal  0.712287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  30.51 
 
 
269 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  26.91 
 
 
276 aa  91.7  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  24.89 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  24.8 
 
 
265 aa  88.6  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1506  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 
279 aa  88.6  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00711463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
249 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.79 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.15 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 
267 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.320524  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 
270 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  31.89 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  32.24 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
276 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.87 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
280 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3477  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
292 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382288  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.35 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  26.56 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 
273 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  28.88 
 
 
595 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  32.53 
 
 
265 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
247 aa  85.9  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0850209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 
595 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
249 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.43 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
238 aa  85.5  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1309  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.73 
 
 
236 aa  85.1  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.358068  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.72 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 
618 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  30.07 
 
 
595 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 
595 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3050  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325921  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.11 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 
595 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38260  short-chain alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913124  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.2 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.24 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.24 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 
595 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.63 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  30.87 
 
 
1270 aa  82.8  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  31.32 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.43 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.32 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 
596 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>