More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7513 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  100 
 
 		 158 aa  320  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  71.24 
 
 		 155 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  66.45 
 
 		 159 aa  220  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  50.33 
 
 		 161 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  38.41 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  38.41 
 
 		 173 aa  131  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  41.18 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  41.18 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  41.18 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  41.18 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  43.2 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  37.33 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  34.87 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  35.53 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  35.53 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  34.21 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  34.21 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  34.21 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  97.8  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  35.48 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 176 aa  94  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  33.12 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 202 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  31.21 
 
 		 175 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  31.21 
 
 		 175 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  31.21 
 
 		 175 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  31.21 
 
 		 175 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  31.21 
 
 		 229 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 202 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  29.94 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  31.79 
 
 		 229 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>