More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4110 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 193 aa  386  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  72.02 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  72.54 
 
 		 188 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  72.54 
 
 		 188 aa  275  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  66.49 
 
 		 186 aa  246  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  66.49 
 
 		 186 aa  246  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  67.02 
 
 		 186 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  67.6 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  58.56 
 
 		 194 aa  203  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.42 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.31 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.33 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.75 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.19 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.19 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  55.62 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.51 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.96 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  49.72 
 
 		 190 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  46.96 
 
 		 190 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  47.78 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  50.56 
 
 		 190 aa  168  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  46.11 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  45.76 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  45.79 
 
 		 217 aa  160  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  48.33 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  44.38 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.24 
 
 		 190 aa  156  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  42.13 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  44.21 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  47.51 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  43.26 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  43.26 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.11 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  46.78 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  43.18 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  43.82 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  36.6 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  41.62 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  33.71 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.23 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  35.88 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.84 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 		 179 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 		 183 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.08 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 		 180 aa  88.6  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 		 180 aa  88.6  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 		 180 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.59 
 
 		 178 aa  87.8  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.07 
 
 		 179 aa  87.8  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 		 178 aa  86.3  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  27.91 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  30.17 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  30.59 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.14 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  29.63 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0178246 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  29.73 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.32 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  29.31 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  30.29 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  28.98 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  34.12 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  33.73 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.17 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.24 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  30.11 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  31.82 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  28.32 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>