More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0376 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  100 
 
 
670 aa  1370    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  71.58 
 
 
668 aa  989    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  66.13 
 
 
676 aa  922    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  63.62 
 
 
666 aa  895    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  68.73 
 
 
673 aa  954    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1748  type II secretion system protein E  57.93 
 
 
723 aa  828    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  68.73 
 
 
673 aa  954    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  84.48 
 
 
670 aa  1179    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00191  general secretion pathway protein E  53.18 
 
 
638 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2264  type II secretion system protein E  46.75 
 
 
769 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.92 
 
 
568 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.07 
 
 
568 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.18 
 
 
568 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06911  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like protein  48.71 
 
 
568 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.44 
 
 
568 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.9 
 
 
568 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1299  General secretory system II protein E domain protein  39.04 
 
 
747 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.48 
 
 
566 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.27 
 
 
568 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1189  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like  49.77 
 
 
594 aa  432  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1268  General secretory system II protein E domain protein  38.39 
 
 
747 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41 
 
 
563 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41 
 
 
568 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  40.57 
 
 
558 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.08 
 
 
553 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  39.24 
 
 
787 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.28 
 
 
571 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  43.01 
 
 
563 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.58 
 
 
871 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.79 
 
 
557 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.93 
 
 
557 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.98 
 
 
568 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  39.31 
 
 
568 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.14 
 
 
568 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  40.29 
 
 
603 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.3 
 
 
568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.07 
 
 
571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  37.83 
 
 
561 aa  405  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  47.52 
 
 
577 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.94 
 
 
571 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.21 
 
 
556 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.61 
 
 
599 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.61 
 
 
599 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.45 
 
 
599 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  40.13 
 
 
561 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  39.13 
 
 
570 aa  398  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  39.67 
 
 
561 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.89 
 
 
558 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  38.66 
 
 
553 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.41 
 
 
564 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  43.65 
 
 
568 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  38.6 
 
 
553 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  40.86 
 
 
572 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  39.41 
 
 
591 aa  392  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  39.74 
 
 
610 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  38.97 
 
 
885 aa  389  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  40.29 
 
 
891 aa  388  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.46 
 
 
572 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  38.37 
 
 
561 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  37.93 
 
 
558 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  37.74 
 
 
555 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  38.18 
 
 
568 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.99 
 
 
577 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  38.16 
 
 
573 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.96 
 
 
577 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.25 
 
 
559 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  37.44 
 
 
573 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.78 
 
 
553 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  36.94 
 
 
565 aa  382  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  39.23 
 
 
579 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.11 
 
 
549 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  39.85 
 
 
560 aa  379  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  38.7 
 
 
571 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  38.58 
 
 
571 aa  379  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.62 
 
 
569 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  48.8 
 
 
727 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.8 
 
 
578 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  42.39 
 
 
500 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  45.23 
 
 
499 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  42.07 
 
 
501 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  43.46 
 
 
489 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  36.12 
 
 
570 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.85 
 
 
569 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  38.81 
 
 
888 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  36.81 
 
 
567 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.42 
 
 
569 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  40.65 
 
 
552 aa  374  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.52 
 
 
569 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.28 
 
 
569 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.24 
 
 
574 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  37.15 
 
 
806 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  46 
 
 
518 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.7 
 
 
578 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  41.62 
 
 
503 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  45.8 
 
 
521 aa  369  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  39.92 
 
 
570 aa  369  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  37.96 
 
 
571 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  45.43 
 
 
521 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  38.36 
 
 
569 aa  369  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  45.43 
 
 
521 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>