243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0705 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
134 aa  275  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.36 
 
 
214 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  40.31 
 
 
224 aa  100  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  36.29 
 
 
223 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.57 
 
 
216 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.74 
 
 
219 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  37.5 
 
 
217 aa  87.4  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.4 
 
 
220 aa  87  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  35.88 
 
 
229 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  33.33 
 
 
248 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  33.33 
 
 
242 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  34.11 
 
 
215 aa  84.7  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 
229 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.09 
 
 
228 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  38.4 
 
 
217 aa  83.6  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.65 
 
 
218 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.08 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.6 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  31.85 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  36.15 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.78 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  31.88 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  31.88 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  31.88 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  35.38 
 
 
217 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  34.35 
 
 
235 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  33.87 
 
 
227 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  32.58 
 
 
220 aa  77.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 
233 aa  77.4  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32.31 
 
 
240 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.6 
 
 
224 aa  77.4  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  33.6 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  36 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  33.6 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.68 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  35.48 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  31.97 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.41 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  32.8 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.83 
 
 
240 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  35.61 
 
 
221 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  31.78 
 
 
237 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.11 
 
 
227 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.83 
 
 
218 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.25 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  28.68 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  33.06 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  29.41 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.87 
 
 
235 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  32 
 
 
220 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  34.38 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  34.51 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  30.53 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  33.98 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  30.33 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.41 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.61 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.79 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  31.97 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  32.28 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.71 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.97 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.97 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.61 
 
 
236 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  32.79 
 
 
231 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  31.19 
 
 
222 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.68 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.61 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.28 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.6 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  31.15 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.51 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.97 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  31.97 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.97 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  29.51 
 
 
234 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  35.2 
 
 
214 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.61 
 
 
227 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  30.63 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  28.23 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.12 
 
 
239 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.21 
 
 
234 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  29.2 
 
 
239 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  32.79 
 
 
230 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  32.79 
 
 
230 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.15 
 
 
229 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  32.79 
 
 
230 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.61 
 
 
172 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0466  iron dependent repressor  29.75 
 
 
210 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.514615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  30.97 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.23 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  32.79 
 
 
230 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  27.56 
 
 
254 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 
226 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  27.48 
 
 
226 aa  62  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>