More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0437 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  53.2 
 
 		 203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 201 aa  215  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 201 aa  214  8e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.74 
 
 		 200 aa  212  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  53.2 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  51.23 
 
 		 200 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  54.37 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 206 aa  211  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 206 aa  211  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  50.74 
 
 		 201 aa  211  9e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  51.47 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 201 aa  208  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  51.71 
 
 		 203 aa  207  9e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  53.69 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 202 aa  206  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  50.74 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 208 aa  206  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  51.72 
 
 		 200 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 207 aa  204  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  54.25 
 
 		 206 aa  204  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  203  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  52.4 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  53.37 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  53.69 
 
 		 202 aa  201  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  50.49 
 
 		 203 aa  201  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  201  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3730  30S ribosomal protein S4  51.23 
 
 		 202 aa  200  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2301  ribosomal protein S4  51.18 
 
 		 208 aa  200  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0792347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0307  30S ribosomal protein S4  53.37 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4303  30S ribosomal protein S4  52.22 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000344205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  52.22 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  52.22 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3891  30S ribosomal protein S4  53.37 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0605  30S ribosomal protein S4  53.37 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000812639  normal  0.600341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  53.55 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  52.71 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  50.74 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  50.74 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  52.4 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  50.74 
 
 		 202 aa  197  6e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  48.53 
 
 		 203 aa  198  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 203 aa  197  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0077  ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 207 aa  197  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0405  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 207 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.916178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4725  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766159  normal  0.270309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0397  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 208 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  52.4 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3782  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3798  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3503  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2607  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3721  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.471129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3144  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0650  ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>