More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7025 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 229 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  67.86 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  63.88 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.02 
 
 		 227 aa  258  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.54 
 
 		 225 aa  245  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.5 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  52.49 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  51.82 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  51.75 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  51.8 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  51.8 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  51.8 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  53.95 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 251 aa  177  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.27 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  46.52 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.78 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 250 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  32.85 
 
 		 258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.6 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  35.78 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  32.65 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 248 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30.94 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  40.97 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.56 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.29 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  36.6 
 
 		 1270 aa  98.6  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 317 aa  98.6  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  35.19 
 
 		 245 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 		 273 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 246 aa  96.3  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06330  oxidoreductase  32.77 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.646831  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07831  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.956383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 283 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  31.78 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 272 aa  95.5  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 246 aa  95.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.836966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 237 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 244 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05381  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0731  short chain dehydrogenase  32.9 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.510402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.62 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.18 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.18 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0563281  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.18 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.18 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.18 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.18 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>