More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4088 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 309 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.25 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  38.65 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  42.15 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.14 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  31.72 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  33.22 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 		 340 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  34.33 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  31.8 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  30.91 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.31 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.75 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 291 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.58 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 		 370 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  33.17 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  40.56 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 291 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2473  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 324 aa  89  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0409911  normal  0.0604811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 287 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  27.14 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.86 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  normal  0.959468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  43.97 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  32.02 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  38.51 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>